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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于COG 分类问题？
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cruier

铜虫 (正式写手)

[求助] 关于COG 分类问题？

完全按照说明进行，将cog0303.fa下载下来重新做的COG，
按要求处理的queryGen, blast之后分别保存到 BLASTno 和BLASTff文件夹中
然后运行 COGreadblast之后的hits.csv中全是cog.fa中的蛋白，query2subject.csv也是cog.fa中的蛋白，self.csv为空，
再运行COGcognitor之后，得到的全是部分cog0303.fa中蛋白的分类信息，请问可能是什么原因导致的呢？


多谢多谢 ！
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1楼 2013-12-18 18:10:21
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sam-lifei

金虫 (小有名气)
恳请LZ把COGs数据库的具体使用步骤写一下，让我们这些初学者稍微容易点。网上没有一个完整的信息，都不知道去哪学习。感谢楼主！
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9楼2015-03-18 20:37:05
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asr

荣誉版主 (知名作家)
你做的各步骤，都是干嘛？知道吗？
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思想极度邪恶，勿怕勿怪！\(^o^)/~
2楼2013-12-20 00:54:30
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liuwei4410

金虫 (正式写手)
你是在做COG的功能注释么？
赞一下 回复此楼
一切都是浮云，开心最重要！
3楼2013-12-21 23:17:32
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cruier

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by asr at 2013-12-20 00:54:30
你做的各步骤，都是干嘛？知道吗？

与cog的开发人员沟通了一下，问题已解决
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愿你们的青春都如同教堂上的天空，有神经过~~
4楼2013-12-27 11:22:58
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