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cruier

铜虫 (正式写手)

[求助] 关于COG 分类问题?

完全按照说明进行,将cog0303.fa下载下来重新做的COG,
按要求处理的queryGen, blast之后分别保存到 BLASTno 和BLASTff文件夹中
然后运行 COGreadblast之后的hits.csv中全是cog.fa中的蛋白,query2subject.csv也是cog.fa中的蛋白,self.csv为空,
再运行COGcognitor之后,得到的全是部分cog0303.fa中蛋白的分类信息,请问可能是什么原因导致的呢?


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愿你们的青春都如同教堂上的天空,有神经过~~
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wang4681060

铁虫 (小有名气)

楼主,COG基因功能注释是怎么做的,麻烦给个具体流程,我最近也准备做,我是做噬菌体的,我只想跟COG里的噬菌体库比,得到基因功能注释,楼主指教!!!
8楼2014-11-07 22:14:06
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asr

荣誉版主 (知名作家)

你做的各步骤,都是干嘛?知道吗?
思想极度邪恶,勿怕勿怪!\(^o^)/~
2楼2013-12-20 00:54:30
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liuwei4410

金虫 (正式写手)

你是在做COG的功能注释么?
一切都是浮云,开心最重要!
3楼2013-12-21 23:17:32
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cruier

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by asr at 2013-12-20 00:54:30
你做的各步骤,都是干嘛?知道吗?

与cog的开发人员沟通了一下,问题已解决
愿你们的青春都如同教堂上的天空,有神经过~~
4楼2013-12-27 11:22:58
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