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麦堂straw银虫 (小有名气)
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求助B-factor值的计算 已有1人参与
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温度因子B-factor的概念起源于晶体研究，主要是用来体现晶体中原子构象状态的一种模糊度，实际上反映了蛋白质分子在晶体中的构象状态，B-factor越高，模糊度越大，相应部位的构象就越不稳定或柔性越强。在晶体学数据中B-factor一般是以原子为单位给出的，通常我们将其换算成相应氨基酸残基的B-factor值，从而可以分析氨基酸残基的构象稳定性或其柔性。 研究发现将蛋白质结构中B-factor值较高的氨基酸突变后部分突变体的热稳定性可以得到明显的提高。 本人研三，正处于毕业论文撰写阶段，课题做的突变库的筛选，已得到一株热稳定性提高的突变株，想在讨论里加入一些蛋白三维建模参数分析，其中一项就包括突变前后氨基酸B-factor值的比较，但查了好多资料说是要用分子动力学软件可以计算出来。由于本人对这方面一窍不通，蛋白建模是直接提交到SWISS-MODEL，只会用PyMol查看一下结构，对分子动力学这块确实没有时间没有精力再去研究，也木有安装过任何软件。无奈到小木虫上求助各位大侠们，有没有哪位好心人可以帮我看一下，分析一下氨基酸突变后的参数？  求赶紧结束毕业论文早日完成毕业大计啊！先谢过啦~~~~  |
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