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lyyjackey

新虫 (小有名气)

[求助] BamHI,SmaI平末端粘性末端连接问题

最近一直在做工程菌构建问题,我的目的片段大约在1000bp左右,载体为7000左右,分别采用BamHI和SmaI对质粒和载体进行双酶切,片段是连到T载体上的,测序正确。PS:酶切位点不能更换了。
    分别双酶切后,割胶后胶回收。
连接体系如下:
片段:4uL
载体:1uL
连接酶:1uL(PS:TAKARA的solutionI连接酶)
在金属浴上16度连接过夜,转化JM109感受态。

感受态之前构建的连T载体转化效率都很高,目前还是在用同一批感受态。
已经做了近一个多月了,一直是平板上什么都没有,空空如也
实验做得已不知所措,希望有这方面经验的可以耐心予以解答,感激不尽。
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lyyjackey

新虫 (小有名气)

不好意思。上面的连接体系中solutionI:5uL
2楼2013-11-22 16:00:41
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远方tony

新虫 (初入文坛)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-22 16:27:27
是什么载体,载体的抗性查对了吗?别把板子的抗性弄错了。
把没学的都补回来。
3楼2013-11-22 16:06:56
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zh10246

铁杆木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2013-11-22 22:12:55
平末端是效率低些,也不至于一个斑也没有吧,转化时建议做好阳性对照,证实感受态是好的,确认你的连接片段有东西,胶回收有的时候没回收到,再做一次,如果不行,建议从头开始,重新设计引物,用合适的酶切位点,一个月没做出来载体,有点长了,这种实验一个星期就该做好。
4楼2013-11-22 19:12:05
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脱水拂空

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2013-11-22 22:13:02
你可以换一下T4连接酶可能效果会好些
5楼2013-11-22 21:28:59
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lyyjackey

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 远方tony at 2013-11-22 16:06:56
是什么载体,载体的抗性查对了吗?别把板子的抗性弄错了。

是一个穿梭质粒,不是很常用的,抗性是没错的,氨苄抗性
6楼2013-11-24 07:51:32
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lyyjackey

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zh10246 at 2013-11-22 19:12:05
平末端是效率低些,也不至于一个斑也没有吧,转化时建议做好阳性对照,证实感受态是好的,确认你的连接片段有东西,胶回收有的时候没回收到,再做一次,如果不行,建议从头开始,重新设计引物,用合适的酶切位点,一 ...

对照是直接转空质粒的,结果是满板的菌,说明平板应该是没有问题的了。
7楼2013-11-24 07:52:13
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overhalfmoon

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-24 21:16:45
请把切完的质粒和片段都跑一下胶。我前两周遇到的问题和你一样,用的thermo的FD sma1,最后发现这个酶竟然会把质粒完全消化掉

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
8楼2013-11-24 08:25:52
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anning529

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

9楼2013-11-24 20:17:35
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alicelchf

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-24 21:16:57
换T4 ligase
另外检测下你酶切回收的效果
修身、齐家、治国、平天下
10楼2013-11-24 20:39:06
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