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我要吃西瓜

金虫 (初入文坛)

[求助] 如何选择原核表达所要用到的限制性内切酶 已有1人参与

如题,本人新手,最近要做原核表达,请问有没有什么软件可以用来分析所需要用的限制性内切酶,直接给出推荐结果的那种,用DNAman得出来的还要一个个去看太麻烦了。。
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kehan777

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
我要吃西瓜: 金币+1, 有帮助, 感谢回复 2013-11-09 11:28:08
myprayer: 金币+1, 鼓励发帖积极交流。 2013-11-09 15:30:23
内容已删除
2楼2013-11-09 10:59:08
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玉婷881213

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by kehan777 at 2013-11-09 10:59:08
VectorNTI 软件,可直接得出限制性内切酶的分析报告,看到Non-cutters中片段没有的酶切位点,和你的载体中有的酶切位点有那些是相同的,最好是你实验室里面现成有的,就是它了,记得加上保护性碱基..

1.jpg
...

请问1.non-cutters是什么意思,是这段基因中没有的内切酶还是有这么多种内切酶?
2.选择内切酶的时候,在基因片段中没有的内切酶中和载体中有的内切酶中,选择一个常用的,对吗?也就是说这一个即能切开载体,也能切开基因片段,对吗?
3楼2014-09-25 22:06:17
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kehan777

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-09-27 17:51:50
引用回帖:
3楼: Originally posted by 玉婷881213 at 2014-09-25 22:06:17
请问1.non-cutters是什么意思,是这段基因中没有的内切酶还是有这么多种内切酶?
2.选择内切酶的时候,在基因片段中没有的内切酶中和载体中有的内切酶中,选择一个常用的,对吗?也就是说这一个即能切开载体,也能 ...

non-cutters就是你分析的片段中没有的酶切位点。
基因片段没有的内切酶中和载体中有的内切酶中,选择一个常用的,对!
即能切开载体,也能切开基因片段?
这是基因片段末端补上了(本身没有)和载体上相同的酶切位点后,才有的;怎么补?可以通过全基因合成,或者合成引物后PCR。
之后通过酶切切基因片段和载体,它们就有了相同的末端,就可以通过连接酶连接起来,形成一个环状的质粒。然后转化到菌里面克隆,表达。
4楼2014-09-26 08:57:29
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