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凌-强

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】RFLP中的限制性内切酶如何选择 已有4人参与

小弟最近要做RFLP,前面DNA是用通用引物做PCR,所以小弟对这里选择限制性内切酶很迷茫,不知道该怎么选择?


大侠们。帮帮忙,解决下
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷


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选碱基数比较少的酶,比如4个碱基的。Dpn I.
Thank-you,so-blue.
2楼2010-10-28 15:39:16
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凌-强

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by susizheng at 2010-10-28 15:39:16:
选碱基数比较少的酶,比如4个碱基的。Dpn I.

能说的详细点吗?


我做的是肠道微生物方面,做的是细菌总DNA,所以才不知道这方面该怎么选酶,我看见有人文章提到用25种酶,太恐怖了
3楼2010-10-28 17:34:09
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

★ ★ ★
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dhd997(金币+2):鼓励交流。 2010-10-28 19:35:59
我的意思是不同的酶切位点识别的碱基对数不同,一般是6个比较常见,但是也有8个的,比如Not I,也有4个的,比如Dpn I。你做多态性分析,尽量选择识别碱基数少的酶切位点,这样的酶切位点一般出现的概率较大,酶切后容易得到差异性。
不过现在这样做多态性分析的很少了,直接全部测序一比对也就完事了,测序也不贵。
Thank-you,so-blue.
4楼2010-10-28 18:29:15
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wangpl191

金虫 (小有名气)


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完全同意3楼的看法,并支持一下。
5楼2010-10-29 10:03:57
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oezp

金虫 (正式写手)

★ ★
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dhd997(金币+1):鼓励交流。 2010-10-29 11:49:07
我们做根瘤菌的 用Msp1, hinf ,hae ...
为了美好的将来而奋斗。。。醒悟
6楼2010-10-29 11:13:41
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凌-强

银虫 (小有名气)

谢谢大家
7楼2010-10-29 16:23:28
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