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如何在ncbi下载拟南芥叶绿体基因组
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我想比较大豆和拟南芥中叶绿体基因组序列，找到基因组序列后，做成一个韦恩图用来比较在叶绿体中这两个物种基因组基因的异同（哪些是在两个物种中保守的，哪些是不同的） 现在的问题是 1.这两个基因组序列在哪里找，我在ncbi里找了拟南芥的但是不知怎么找叶绿体的基因组 2.如何比对（用什么软件）。 我是完全不熟悉这一块的状态 这应该属于比较基因组学的内容吧 哪位高手帮忙指点一下  |
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2楼2013-11-04 22:46:11
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【答案】应助回帖
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gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-11-05 11:52:49
虫布丁: 金币+15, ★★★★★最佳答案, 谢谢！已经按您的方法下载下来了 但是发现里面序列的基因号是RefSeq INSDC两个库的名称，而我老师给我的资料里面需要比对的基因是基因名来标注的AtCg00680.1这样的基因名的是在哪里找的呢 不甚感激！ 2013-11-06 10:08:45
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-11-05 11:52:49
虫布丁: 金币+15, ★★★★★最佳答案, 谢谢！已经按您的方法下载下来了 但是发现里面序列的基因号是RefSeq INSDC两个库的名称，而我老师给我的资料里面需要比对的基因是基因名来标注的AtCg00680.1这样的基因名的是在哪里找的呢 不甚感激！ 2013-11-06 10:08:45
| 关于第二个问题，我觉得一般的比对软件即可，因为这两个叶绿体基因组注释信息非常详细，有多少基因，每个基因的名称，在叶绿体基因组中的位置等等都可以查到，直接根据注释信息就可以做图、比对。 |
3楼2013-11-04 23:07:59
stone2239
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在拟南芥专业网站TAIR（http://www.arabidopsis.org/）上可以下到，在网页上方搜索框中输入该基因号，直接点search就可以，并且可以找到对应的NCBI登录号。 |
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虫布丁5楼2013-11-06 11:53:05
stone2239
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