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求问PopGene软件数据文件内数据排列问题
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小弟最近在用PopGene处理数据，但是有一事一直不太明白，看了些文献依旧不是很懂，忘高手不吝赐教啊。 背景：SRAP种群遗传多样性分析。一共是12个种群，每个种群8到12个样品。一共用了11对引物。 ————————————我是多态性分割线———————————————— 我看了一下PopGene的帮助文件，它里面的数据格式是这个样子的。 /* Diploid alphabetic data of 3 populations each with varying records (genotypes) & 5 loci */ Number of populations = 2 Number of loci =28 Locus name : OPA01-1 OPA01-2 OPA01-3 OPA01-4 OPA01-5 OPA03-1 OPA03-2 OPA03-3 OPA03-4 OPA03-5 OPA03-6 OPA04-1 OPA04-2 OPA04-3 OPA04-4 OPA04-5 OPA04-6 OPA04-7 OPA07-1 OPA07-2 OPA07-3 OPA07-4 OPA07-5 OPA07-6 OPA11-1 OPA11-2 OPA11-3 OPA11-4 name = Slave Lake fis = -0.238 11101 100100 0111010 001000 1001 10110 100100 0011010 001000 0001 11100 100100 0011010 001000 0001 11111 100100 0011010 001010 0001 10110 101100 0011010 001010 1101 我这个地方就不懂了。  我这12对引物，12个居群，每个居群10个左右样品时如何组织到这个文件里面的。就是我现在懂了文件的数据格式，但是不知道这个数据结构。 小弟嘴拙，不知道表达清楚没有。  望前辈指教。 PS：还想问一下这个 fis 是什么东西，不考虑它行么？ [ Last edited by lzbull on 2013-10-29 at 16:11 ] |
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2楼2013-10-29 20:45:29
dplfly
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