应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 请教如何加快siesta的收敛速度
51/1返回列表
查看: 2255  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

xiongxiong5712

新虫 (小有名气)

[求助] 请教如何加快siesta的收敛速度

最近算一个252个原子的纳米线，速度挺慢的，算了3、4天了还在算，循环了100多个CG，原子受力不断震荡，每个CG中达到上百个scf循环，查了一下内存应该没有问题，我觉得是不是我的参数设置不合理造成的，因为除了DM.MixingWeight和DM.NumberPulay是我设置的，其他参数基本都是默认值，想请教各位高手，除了修改DM.MixingWeight和DM.NumberPulay以外，还应该调哪些参数来加快收敛速度呢？看了手册也不知道该从哪下手，下面是我的fdf文件，麻烦各位帮忙看看，不甚感激：
SystemName          2-001331
SystemLabel         2-001331

NumberOfAtoms       252
NumberOfSpecies     2

%block ChemicalSpeciesLabel
1   14  Si
2   7   N
%endblock ChemicalSpeciesLabel

LatticeConstant     1 Ang

%block LatticeVectors
      33.164442837925073     -19.147500000000008       0.000000000000002
       0.000000000000000      38.295000000000002       0.000000000000002
       0.000000000000000       0.000000000000000       5.622000000000000
%endblock LatticeVectors

%block kgrid_Monkhorst_Pack
1 0 0 0
0 1 0 0
0 0 1 0
%endblock kgrid_Monkhorst_Pack

AtomicCoordinatesFormat     Fractional         
%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
0.0703604909257081         0.1948600339469900         0.9690000000000010         2
0.0650885233059144         0.0646829873351612         0.2340000000000000         2
0.0079079514296906         0.0782684423553988         0.9690000000000010         2
0.1380849980415190         0.0004055359707532         0.2340000000000000         2
0.1244995430212820         0.1324074944509720         0.9690000000000010         2
0.2023624494059270         0.1376794620707660         0.2339999999999990         2
0.1948600339469900         0.0703604909257082         0.4690000000000010         2
0.0646829873351612         0.0650885233059145         0.7340000000000000         2
0.0782684423553987         0.0079079514296906         0.4690000000000010         2
0.0004055359707532         0.1380849980415190         0.7340000000000000         2
0.1324074944509720         0.1244995430212820         0.4690000000000010         2
0.1376794620707660         0.2023624494059270         0.7339999999999990         2
0.0000000000000000         0.0000000000000000         0.0000000000000000         2
0.0000000000000000         0.0000000000000000         0.5000000000000000         2
0.0675893284588936         0.1351786569177870         0.6500000000000000         2
0.1351786569177870         0.0675893284588936         0.1500000000000000         2
0.2731284763023880         0.1948600339469900         0.9690000000000010         2
0.2678565086825950         0.0646829873351612         0.2339999999999990         2
0.2106759368063710         0.0782684423553988         0.9690000000000010         2
0.3408529834182000         0.0004055359707532         0.2339999999999990         2
0.3272675283979630         0.1324074944509720         0.9690000000000010         2
0.4051304347826080         0.1376794620707660         0.2339999999999990         2
0.3976280193236710         0.0703604909257082         0.4690000000000010         2
0.2674509727118420         0.0650885233059144         0.7339999999999990         2
0.2810364277320790         0.0079079514296906         0.4690000000000010         2
0.2031735213474340         0.1380849980415190         0.7339999999999990         2
0.3351754798276530         0.1244995430212820         0.4690000000000010         2
0.3404474474474470         0.2023624494059270         0.7339999999999990         2
0.2027679853766800         0.0000000000000000         -0.0000000000000001         2
0.2027679853766800         0.0000000000000000         0.4999999999999990         2
0.2703573138355740         0.1351786569177870         0.6500000000000000         2
0.3379466422944680         0.0675893284588936         0.1499999999999990         2
0.4758964616790690         0.1948600339469900         0.9690000000000010         2
0.4706244940592760         0.0646829873351611         0.2339999999999990         2
0.4134439221830520         0.0782684423553987         0.9690000000000010         2
0.5436209687948810         0.0004055359707531         0.2339999999999990         2
0.5300355137746430         0.1324074944509720         0.9690000000000010         2
0.6078984201592890         0.1376794620707660         0.2339999999999990         2
0.6003960047003520         0.0703604909257081         0.4690000000000010         2
0.4702189580885220         0.0650885233059143         0.7339999999999990         2
0.4838044131087600         0.0079079514296905         0.4690000000000010         2
0.4059415067241140         0.1380849980415190         0.7339999999999990         2
0.5379434652043340         0.1244995430212820         0.4690000000000010         2
0.5432154328241270         0.2023624494059270         0.7339999999999990         2
0.4055359707533610         -0.0000000000000001         -0.0000000000000001         2
0.4055359707533610         -0.0000000000000001         0.4999999999999990         2
0.4731252992122550         0.1351786569177870         0.6499999999999990         2
0.5407146276711490         0.0675893284588936         0.1499999999999990         2
0.0703604909257081         0.3976280193236710         0.9690000000000010         2
0.0650885233059144         0.2674509727118420         0.2339999999999990         2
0.0079079514296906         0.2810364277320790         0.9690000000000010         2
0.1380849980415190         0.2031735213474340         0.2339999999999990         2
0.1244995430212820         0.3351754798276530         0.9690000000000010         2
0.2023624494059270         0.3404474474474470         0.2339999999999990         2
0.1948600339469900         0.2731284763023890         0.4690000000000010         2
0.0646829873351612         0.2678565086825950         0.7339999999999990         2
0.0782684423553987         0.2106759368063710         0.4690000000000010         2
0.0004055359707532         0.3408529834182000         0.7339999999999990         2
0.1324074944509720         0.3272675283979630         0.4690000000000010         2
0.1376794620707660         0.4051304347826080         0.7339999999999990         2
0.0000000000000000         0.2027679853766810         -0.0000000000000001         2
0.0000000000000000         0.2027679853766810         0.4999999999999990         2
0.0675893284588936         0.3379466422944680         0.6500000000000000         2
0.1351786569177870         0.2703573138355740         0.1499999999999990         2
0.2731284763023880         0.3976280193236710         0.9690000000000010         2
0.2678565086825950         0.2674509727118420         0.2339999999999990         2
0.2106759368063710         0.2810364277320790         0.9690000000000010         2
0.3408529834182000         0.2031735213474340         0.2339999999999990         2
0.3272675283979630         0.3351754798276530         0.9690000000000010         2
0.4051304347826080         0.3404474474474470         0.2339999999999990         2
0.3976280193236710         0.2731284763023890         0.4690000000000010         2
0.2674509727118420         0.2678565086825950         0.7339999999999990         2
0.2810364277320790         0.2106759368063710         0.4690000000000010         2
0.2031735213474340         0.3408529834182000         0.7339999999999990         2
0.3351754798276530         0.3272675283979630         0.4690000000000010         2
0.3404474474474470         0.4051304347826080         0.7339999999999990         2
0.2027679853766800         0.2027679853766810         -0.0000000000000001         2
0.2027679853766800         0.2027679853766810         0.4999999999999990         2
0.2703573138355740         0.3379466422944680         0.6499999999999990         2
0.3379466422944680         0.2703573138355740         0.1499999999999990         2
0.4758964616790690         0.3976280193236710         0.9690000000000010         2
0.4706244940592760         0.2674509727118420         0.2339999999999990         2
0.4134439221830520         0.2810364277320790         0.9690000000000010         2
0.5436209687948810         0.2031735213474340         0.2339999999999990         2
0.5300355137746430         0.3351754798276530         0.9690000000000010         2
0.6078984201592890         0.3404474474474470         0.2339999999999990         2
0.6003960047003520         0.2731284763023890         0.4690000000000010         2
0.4702189580885220         0.2678565086825950         0.7339999999999990         2
0.4838044131087600         0.2106759368063710         0.4690000000000010         2
0.4059415067241140         0.3408529834182000         0.7339999999999990         2
0.5379434652043340         0.3272675283979630         0.4690000000000010         2
0.5432154328241270         0.4051304347826080         0.7339999999999990         2
0.4055359707533610         0.2027679853766810         -0.0000000000000002         2
0.4055359707533610         0.2027679853766810         0.4999999999999990         2
0.4731252992122550         0.3379466422944680         0.6499999999999990         2
0.5407146276711490         0.2703573138355740         0.1499999999999990         2
0.0703604909257081         0.6003960047003520         0.9690000000000010         2
0.0650885233059144         0.4702189580885230         0.2339999999999990         2
0.0079079514296906         0.4838044131087600         0.9690000000000010         2
0.1380849980415190         0.4059415067241150         0.2339999999999990         2
0.1244995430212820         0.5379434652043340         0.9690000000000010         2
0.2023624494059270         0.5432154328241280         0.2339999999999990         2
0.1948600339469900         0.4758964616790700         0.4690000000000010         2
0.0646829873351612         0.4706244940592760         0.7339999999999990         2
0.0782684423553987         0.4134439221830520         0.4690000000000010         2
0.0004055359707532         0.5436209687948810         0.7339999999999990         2
0.1324074944509720         0.5300355137746440         0.4690000000000010         2
0.1376794620707660         0.6078984201592890         0.7339999999999990         2
0.0000000000000000         0.4055359707533620         -0.0000000000000001         2
0.0000000000000000         0.4055359707533620         0.4999999999999990         2
0.0675893284588936         0.5407146276711490         0.6499999999999990         2
0.1351786569177870         0.4731252992122550         0.1499999999999990         2
0.2731284763023880         0.6003960047003520         0.9690000000000010         2
0.2678565086825950         0.4702189580885230         0.2339999999999990         2
0.2106759368063710         0.4838044131087600         0.9690000000000010         2
0.3408529834182000         0.4059415067241150         0.2339999999999990         2
0.3272675283979630         0.5379434652043340         0.9690000000000010         2
0.4051304347826080         0.5432154328241280         0.2339999999999990         2
0.3976280193236710         0.4758964616790700         0.4690000000000010         2
0.2674509727118420         0.4706244940592760         0.7339999999999990         2
0.2810364277320790         0.4134439221830520         0.4690000000000010         2
0.2031735213474340         0.5436209687948810         0.7339999999999990         2
0.3351754798276530         0.5300355137746440         0.4690000000000010         2
0.3404474474474470         0.6078984201592890         0.7339999999999990         2
0.2027679853766800         0.4055359707533620         -0.0000000000000002         2
0.2027679853766800         0.4055359707533620         0.4999999999999990         2
0.2703573138355740         0.5407146276711490         0.6499999999999990         2
0.3379466422944680         0.4731252992122550         0.1499999999999990         2
0.4758964616790690         0.6003960047003520         0.9690000000000010         2
0.4706244940592760         0.4702189580885230         0.2339999999999990         2
0.4134439221830520         0.4838044131087600         0.9690000000000010         2
0.5436209687948810         0.4059415067241150         0.2339999999999990         2
0.5300355137746430         0.5379434652043340         0.9690000000000010         2
0.6078984201592890         0.5432154328241280         0.2339999999999990         2
0.6003960047003520         0.4758964616790700         0.4690000000000010         2
0.4702189580885220         0.4706244940592760         0.7339999999999990         2
0.4838044131087600         0.4134439221830520         0.4690000000000010         2
0.4059415067241140         0.5436209687948810         0.7339999999999990         2
0.5379434652043340         0.5300355137746440         0.4690000000000010         2
0.5432154328241270         0.6078984201592890         0.7339999999999990         2
0.4055359707533610         0.4055359707533620         -0.0000000000000003         2
0.4055359707533610         0.4055359707533620         0.4999999999999990         2
0.4731252992122550         0.5407146276711490         0.6499999999999990         2
0.5407146276711490         0.4731252992122550         0.1499999999999990         2
0.1033102885494180         0.0163430996213604         0.1980000000000000         1
0.0339636375505939         0.0519086042564302         0.9930000000000010         1
0.1864248857553200         0.0869671889280583         0.1980000000000000         1
0.1508593811202500         0.1848230186708440         0.9930000000000010         1
0.1158007964486220         0.0994576968272623         0.1980000000000000         1
0.0179449667058363         0.1688043478260870         0.9930000000000010         1
0.0163430996213604         0.1033102885494180         0.6980000000000000         1
0.0519086042564302         0.0339636375505939         0.4930000000000010         1
0.0869671889280582         0.1864248857553200         0.6980000000000000         1
0.1848230186708440         0.1508593811202500         0.4930000000000010         1
0.0994576968272622         0.1158007964486220         0.6980000000000000         1
0.1688043478260870         0.0179449667058363         0.4930000000000010         1
0.3060782739260990         0.0163430996213604         0.1980000000000000         1
0.2367316229272740         0.0519086042564302         0.9930000000000010         1
0.3891928711320010         0.0869671889280583         0.1980000000000000         1
0.3536273664969310         0.1848230186708440         0.9930000000000010         1
0.3185687818253030         0.0994576968272623         0.1980000000000000         1
0.2207129520825170         0.1688043478260870         0.9930000000000010         1
0.2191110849980410         0.1033102885494180         0.6980000000000000         1
0.2546765896331110         0.0339636375505938         0.4930000000000010         1
0.2897351743047390         0.1864248857553200         0.6980000000000000         1
0.3875910040475250         0.1508593811202500         0.4930000000000010         1
0.3022256822039430         0.1158007964486220         0.6980000000000000         1
0.3715723332027670         0.0179449667058363         0.4930000000000010         1
0.5088462593027800         0.0163430996213604         0.1980000000000000         1
0.4394996083039550         0.0519086042564302         0.9930000000000010         1
0.5919608565086820         0.0869671889280582         0.1980000000000000         1
0.5563953518736120         0.1848230186708440         0.9930000000000010         1
0.5213367672019840         0.0994576968272621         0.1980000000000000         1
0.4234809374591980         0.1688043478260870         0.9930000000000010         1
0.4218790703747220         0.1033102885494180         0.6980000000000000         1
0.4574445750097910         0.0339636375505938         0.4930000000000010         1
0.4925031596814190         0.1864248857553200         0.6980000000000000         1
0.5903589894242060         0.1508593811202500         0.4930000000000010         1
0.5049936675806230         0.1158007964486220         0.6980000000000000         1
0.5743403185794480         0.0179449667058363         0.4930000000000010         1
0.1033102885494180         0.2191110849980410         0.1980000000000000         1
0.0339636375505939         0.2546765896331110         0.9930000000000010         1
0.1864248857553200         0.2897351743047390         0.1980000000000000         1
0.1508593811202500         0.3875910040475250         0.9930000000000010         1
0.1158007964486220         0.3022256822039430         0.1980000000000000         1
0.0179449667058363         0.3715723332027680         0.9930000000000010         1
0.0163430996213604         0.3060782739260990         0.6980000000000000         1
0.0519086042564302         0.2367316229272740         0.4930000000000010         1
0.0869671889280582         0.3891928711320010         0.6980000000000000         1
0.1848230186708440         0.3536273664969310         0.4930000000000010         1
0.0994576968272622         0.3185687818253030         0.6980000000000000         1
0.1688043478260870         0.2207129520825170         0.4930000000000010         1
0.3060782739260990         0.2191110849980410         0.1980000000000000         1
0.2367316229272740         0.2546765896331110         0.9930000000000010         1
0.3891928711320010         0.2897351743047390         0.1980000000000000         1
0.3536273664969310         0.3875910040475250         0.9930000000000010         1
0.3185687818253030         0.3022256822039430         0.1980000000000000         1
0.2207129520825170         0.3715723332027680         0.9930000000000010         1
0.2191110849980410         0.3060782739260990         0.6980000000000000         1
0.2546765896331110         0.2367316229272740         0.4930000000000010         1
0.2897351743047390         0.3891928711320010         0.6980000000000000         1
0.3875910040475250         0.3536273664969310         0.4930000000000010         1
0.3022256822039430         0.3185687818253030         0.6980000000000000         1
0.3715723332027670         0.2207129520825170         0.4930000000000010         1
0.5088462593027800         0.2191110849980410         0.1980000000000000         1
0.4394996083039550         0.2546765896331110         0.9930000000000010         1
0.5919608565086820         0.2897351743047390         0.1980000000000000         1
0.5563953518736120         0.3875910040475250         0.9930000000000010         1
0.5213367672019840         0.3022256822039430         0.1980000000000000         1
0.4234809374591980         0.3715723332027680         0.9930000000000010         1
0.4218790703747220         0.3060782739260990         0.6980000000000000         1
0.4574445750097910         0.2367316229272740         0.4930000000000010         1
0.4925031596814190         0.3891928711320010         0.6980000000000000         1
0.5903589894242060         0.3536273664969310         0.4930000000000010         1
0.5049936675806230         0.3185687818253030         0.6980000000000000         1
0.5743403185794480         0.2207129520825170         0.4930000000000010         1
0.1033102885494180         0.4218790703747220         0.1980000000000000         1
0.0339636375505939         0.4574445750097920         0.9930000000000010         1
0.1864248857553200         0.4925031596814200         0.1980000000000000         1
0.1508593811202500         0.5903589894242060         0.9930000000000010         1
0.1158007964486220         0.5049936675806240         0.1980000000000000         1
0.0179449667058363         0.5743403185794490         0.9930000000000010         1
0.0163430996213604         0.5088462593027800         0.6980000000000000         1
0.0519086042564302         0.4394996083039550         0.4930000000000010         1
0.0869671889280582         0.5919608565086820         0.6980000000000000         1
0.1848230186708440         0.5563953518736120         0.4930000000000010         1
0.0994576968272622         0.5213367672019840         0.6980000000000000         1
0.1688043478260870         0.4234809374591980         0.4930000000000010         1
0.3060782739260990         0.4218790703747220         0.1980000000000000         1
0.2367316229272740         0.4574445750097920         0.9930000000000010         1
0.3891928711320010         0.4925031596814200         0.1980000000000000         1
0.3536273664969310         0.5903589894242060         0.9930000000000010         1
0.3185687818253030         0.5049936675806240         0.1980000000000000         1
0.2207129520825170         0.5743403185794490         0.9930000000000010         1
0.2191110849980410         0.5088462593027800         0.6980000000000000         1
0.2546765896331110         0.4394996083039550         0.4930000000000010         1
0.2897351743047390         0.5919608565086820         0.6980000000000000         1
0.3875910040475250         0.5563953518736120         0.4930000000000010         1
0.3022256822039430         0.5213367672019840         0.6980000000000000         1
0.3715723332027670         0.4234809374591980         0.4930000000000010         1
0.5088462593027800         0.4218790703747220         0.1980000000000000         1
0.4394996083039550         0.4574445750097920         0.9930000000000010         1
0.5919608565086820         0.4925031596814200         0.1980000000000000         1
0.5563953518736120         0.5903589894242060         0.9930000000000010         1
0.5213367672019840         0.5049936675806240         0.1980000000000000         1
0.4234809374591980         0.5743403185794490         0.9930000000000010         1
0.4218790703747220         0.5088462593027800         0.6980000000000000         1
0.4574445750097910         0.4394996083039550         0.4930000000000010         1
0.4925031596814190         0.5919608565086820         0.6980000000000000         1
0.5903589894242060         0.5563953518736120         0.4930000000000010         1
0.5049936675806230         0.5213367672019840         0.6980000000000000         1
0.5743403185794480         0.4234809374591980         0.4930000000000010         1
%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies

xc.functional         LDA           
xc.authors            CA
MeshCutoff            100 Ry

MD.MaxForceTol       0.04 eV/Ang

PAO.BasisSize        DZP

DM.MixingWeight      0.01
DM.NumberPulay       10
MaxSCFIterations     200
  
SolutionMethod       diagon   

MD.TypeOfRun         CG
MD.NumCGsteps        500
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

siesta问题

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-10-18 20:33:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiongxiong5712

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by identation at 2013-10-21 12:59:15
请点击回复此楼按钮...

就是点击回复此楼啊，没有任何反应。再试试
赞一下 回复此楼
7楼2013-10-21 15:53:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

zhangguangping

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2013-10-20 09:15:26
你试试把MeshCutoff调大点，200或者大点。好像100确实有点小。另外你的基组指定的是DZP，那个PAO.EnergyShift默认是272 meV，你设置小一点，比如100 meV.
赞一下(1人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
2楼2013-10-19 19:33:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiongxiong5712

新虫 (小有名气)
谢谢您的回复。但是我不明白为什么要把MeshCutoff调大，PAO.EnergyShift调小，这样计算量不是更大了吗？本来体系就比较大（252个原子），再把参数精度调高，会不会更难算？
赞一下 回复此楼
3楼2013-10-21 09:25:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

584931986

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
identation: 金币+2, 谢谢指教 2013-10-21 12:58:20
在计算石墨烯等碳基体系时，利用DZP也很难收敛，所以文献中大部分人都是用的SZP。虽然精度降低，但基本性质还是可以表征出来的，你可以试试SZP。
赞一下 回复此楼
sunnymojie
4楼2013-10-21 11:15:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭