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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 多肽分子量到其氨基酸
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liuqizong

新虫 (初入文坛)

[求助] 多肽分子量到其氨基酸

已知多肽的分子量，有没有类似数据库之类的软件方便查找多肽分子中都有哪些氨基酸的？
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立志做个学术女。
1楼 2013-10-16 14:48:57
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taccycle

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2013-10-16 18:36:49
这个有点难度啊，根据分子量基本上可以算出有序列中有几个氨基酸，但是具体是那些氨基酸应该就没有办法了，一个氨基酸的相对分子质量平均是110
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用心
2楼2013-10-16 15:55:20
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mguo15

银虫 (小有名气)
★
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖交流！ 2013-10-16 18:36:56
没有，不过如果肽不大的话，如果有aa组成，可以通过纯品ms质谱碎片自己推断。
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3楼2013-10-16 16:43:45
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杨传胜
顶
4楼2013-10-16 17:12:33
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wuyao0513

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liuqizong: 金币+1 2013-10-22 10:35:49
打个质谱吧，一张也就200来块钱，省心省事，还准确
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5楼2013-10-16 23:13:25
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liuqizong

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by wuyao0513 at 2013-10-16 23:13:25
打个质谱吧，一张也就200来块钱，省心省事，还准确

是说MS-MS么？
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立志做个学术女。
6楼2013-10-22 10:35:41
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fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲，勿施于人

【答案】应助回帖

★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-10-22 14:22:30
虽然我不是搞蛋白组学的，但是我可以确定通过多肽分子量是可以推算出氨基酸的，并且有这种软件，你可以在expasy上找找试试。我以前有位朋友是做这个的。
事实上LC-MS/MS在一级谱的时候已经推算出了氨基酸的组成，只是不知道顺序而已。从某种程度上讲二级谱只是确定顺序以及一些PTM的具体位置
但是要能推算出氨基酸，必须保证质谱足够精确，大概要精确到小数点后两三位的样子。如果不足够精确，比如CH4,NH2和O就不能区分开。
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The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
7楼2013-10-22 13:04:57
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