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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 关于高斯PCM模型输入问题

我想要UFF力场来考虑溶剂的半径，输入文件如下：
#p b3lyp/6-311++G(d,p) scf=tight scrf=(pcm,read,solvent=acetone) opt freq
分子坐标....

radii=UFF

我想问下：1.这样的输入文件，高斯是不是读取UFF力场下的丙酮溶剂半径？
          2.同时，默认溶剂其他性质例如介电常数之类，仍然是丙酮的吧？
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1楼 2013-10-13 11:24:27
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
cg陈: 金币+2, ★有帮助 2013-10-14 09:52:25
引用回帖:
4楼: Originally posted by cg陈 at 2013-10-14 09:20:32
你指的是09的吧？我的03，03貌似没有默认是UFF。
其实我想知道这个仅仅只是定义了分子空穴的半径，不影响溶剂的其他参数吧？我怕高斯会默认是水的参数。...

我的是09的，但是定义应该是一样的。
既然你已经选择了溶剂，应该是不影响溶剂其他参数的。分子后面的输入部分只是对于你在命令行指定的操作的部分修改做说明，这是我的理解。
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5楼2013-10-14 09:45:37
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
cg陈: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-10-14 09:18:02
gmy1990: 金币+2 2013-10-14 15:13:51
UFF应是高斯默认的，最后那句加与不加结果应该一致。以下节选自说明书：

“指定分子空穴
程序默认用UFF 半径构造空穴，也就是在每个溶质原子周围放置一个球，其半径用因
子1.1 换算。”
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3楼2013-10-14 08:49:33
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-14 08:49:33
UFF应是高斯默认的，最后那句加与不加结果应该一致。以下节选自说明书：

“指定分子空穴
程序默认用UFF 半径构造空穴，也就是在每个溶质原子周围放置一个球，其半径用因
子1.1 换算。”

你指的是09的吧？我的03，03貌似没有默认是UFF。
其实我想知道这个仅仅只是定义了分子空穴的半径，不影响溶剂的其他参数吧？我怕高斯会默认是水的参数。
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4楼2013-10-14 09:20:32
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-14 09:45:37
我的是09的，但是定义应该是一样的。
既然你已经选择了溶剂，应该是不影响溶剂其他参数的。分子后面的输入部分只是对于你在命令行指定的操作的部分修改做说明，这是我的理解。...

现在杂志还认可PCM模型模拟溶剂溶剂化效应吗？
主流是什么模型呢？
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6楼2013-10-14 09:54:19
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