24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3123  |  回复: 16
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 关于高斯PCM模型输入问题

我想要UFF力场来考虑溶剂的半径,输入文件如下:
#p b3lyp/6-311++G(d,p) scf=tight scrf=(pcm,read,solvent=acetone) opt freq
分子坐标....

radii=UFF

我想问下:1.这样的输入文件,高斯是不是读取UFF力场下的丙酮溶剂半径?
          2.同时,默认溶剂其他性质例如介电常数之类,仍然是丙酮的吧?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cg陈: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-10-14 09:18:02
gmy1990: 金币+2 2013-10-14 15:13:51
UFF应是高斯默认的,最后那句加与不加结果应该一致。以下节选自说明书:

“指定分子空穴
程序默认用UFF 半径构造空穴,也就是在每个溶质原子周围放置一个球,其半径用因
子1.1 换算。”
3楼2013-10-14 08:49:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-14 08:49:33
UFF应是高斯默认的,最后那句加与不加结果应该一致。以下节选自说明书:

“指定分子空穴
程序默认用UFF 半径构造空穴,也就是在每个溶质原子周围放置一个球,其半径用因
子1.1 换算。”

你指的是09的吧?我的03,03貌似没有默认是UFF。
其实我想知道这个仅仅只是定义了分子空穴的半径,不影响溶剂的其他参数吧?我怕高斯会默认是水的参数。
4楼2013-10-14 09:20:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
cg陈: 金币+2, 有帮助 2013-10-14 09:52:25
引用回帖:
4楼: Originally posted by cg陈 at 2013-10-14 09:20:32
你指的是09的吧?我的03,03貌似没有默认是UFF。
其实我想知道这个仅仅只是定义了分子空穴的半径,不影响溶剂的其他参数吧?我怕高斯会默认是水的参数。...

我的是09的,但是定义应该是一样的。
既然你已经选择了溶剂,应该是不影响溶剂其他参数的。分子后面的输入部分只是对于你在命令行指定的操作的部分修改做说明,这是我的理解。
5楼2013-10-14 09:45:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-14 09:45:37
我的是09的,但是定义应该是一样的。
既然你已经选择了溶剂,应该是不影响溶剂其他参数的。分子后面的输入部分只是对于你在命令行指定的操作的部分修改做说明,这是我的理解。...

现在杂志还认可PCM模型模拟溶剂溶剂化效应吗?
主流是什么模型呢?
6楼2013-10-14 09:54:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 华师大读博 +3 xq83 2026-04-22 5/250 2026-04-22 10:42 by xq83
[考研] 0854求调剂 +24 门路摸摸 2026-04-15 28/1400 2026-04-22 09:54 by Sy199704!
[论文投稿] 急需审稿人!!! +3 陆小果画大饼 2026-04-21 3/150 2026-04-21 23:54 by jzy_123456
[考博] 申博/考博 +4 啃面包的小书虫 2026-04-17 8/400 2026-04-21 16:26 by 啃面包的小书虫
[考研] 295分求调剂 +6 ?要上岸? 2026-04-17 6/300 2026-04-21 08:18 by Equinoxhua
[考研] 一志愿中科大材料与化工,353分还有调剂学校吗 +11 否极泰来2026 2026-04-15 13/650 2026-04-20 22:31 by Equinoxhua
[考研] 085600材料与化工调剂 5+3 孜孜不倦2002 2026-04-19 6/300 2026-04-20 21:25 by babero
[论文投稿] 期刊推荐 +3 材料研究生 2026-04-15 5/250 2026-04-20 16:02 by 豆豆7758
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[考研] 337求调剂 +3 jyz04 2026-04-18 3/150 2026-04-20 12:24 by 研可安
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 294求调剂 +8 淡然654321 2026-04-17 9/450 2026-04-19 19:51 by Equinoxhua
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂 +10 小聂爱学习 2026-04-16 12/600 2026-04-19 16:51 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 300求调剂 +12 橙a777 2026-04-15 12/600 2026-04-18 23:51 by 路病情
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
信息提示
请填处理意见