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用易错PCR和In-Fusion技术构建突变文库为什么不成功? 已有1人参与
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首先我用高保真的酶(NEB公司的Phusion酶)扩增目的片段(设计引物时使得目的基因的5'-末端分别与线性化载体末端含有15bp同源区段),然后将纯化后的PCR产物(切胶回收)与纯化后的线性化载体(切胶回收)用Clontech公司的In-Fusion酶连接并转化天根公司的TOP10感受态细胞,平板上出现上百个菌落,阳性克隆率达到75%。 然后我用易错PCR产物(同源区段也是15bp)与上述同样的线性化载体用In-Fusion酶连接并转化TOP10感受态细胞,易错PCR片段和载体的处理方法都是切胶回收,并且回收后的浓度都一样,即线性化载体50ng/ul、PCR片段100ng/ul,都是用NEB公司的1kb DNA Ladder定量的,结果平板上只长1-2个克隆,不知道这是怎么回事? 易错PCR条件是:0.2mM dATP和dCTP,1mM dGTP和dTTP,7mM MgCl2,0.5mM MnCl2,并且是用保真性低的普通Taq酶进行扩增,不知道会不会是因为扩增后3‘末端的A尾巴影响了同源重组反应?但是Clontech公司的In-Fusion酶的说明书上说,PCR产物3’末端有无A并不影响啊。我现在也是找不出原因,为什么用高保真的PCR酶可以做出来,而低保真性的PCR酶做就做不出来呢? |
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2楼2013-10-28 11:54:55
15222569263
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