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zhengjunguan

新虫 (初入文坛)

[求助] 磷脂脂肪酸数据处理问题 已有1人参与

在拿到磷脂脂肪酸数据之后,才发现后期数据整理和处理是件非常麻烦的事。目前有三个问题不知道怎么解决?
1. PLFA(nmol/g)计算公式的疑问:请教了好几个人,结果得到2个版本的公式。区别在于计算公式中,有的说用目标脂肪酸的摩尔质量(即分子量),有的说用内标脂肪酸(19:0)的摩尔质量。不知道到底哪个是对的。
2.我的数据结果中,碳链长度小于14的,有好几个类型含量较高,如12:0、12:1 at 11-12、13:0、13:1 at 12-13,但是这些类型在文献中都找不到该归到哪类微生物的依据,所以不知道该怎么分类。
3. 这两类型16:0 N alcohol和16:1 w7c alcohol的结构式或分子式是什么,以便于计算分子量,它们应该归于哪类微生物。
因这些问题的困扰,导致数据分析没法进行下去。恳请大侠们在百忙之中指点一下,万分感谢!!!
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xenophobe3868

木虫 (小有名气)

我也在弄这个,一脸迷茫啊。哥们你在哪儿做的?是送出去测定么?
2楼2013-10-12 13:15:15
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fwen2011

铜虫 (小有名气)

同学,你找到方法了么?我也在找呢
3楼2013-10-14 11:59:16
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zhengjunguan

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xenophobe3868 at 2013-10-12 13:15:15
我也在弄这个,一脸迷茫啊。哥们你在哪儿做的?是送出去测定么?

才看到你的回帖,实在不好意思,我在中科院植物所做的
4楼2013-11-15 19:57:51
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zhengjunguan

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by fwen2011 at 2013-10-14 11:59:16
同学,你找到方法了么?我也在找呢

找了各种版本,说法不一
5楼2013-11-15 20:00:20
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niuleiinter

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zhengjunguan at 2013-11-15 20:00:20
找了各种版本,说法不一...

请问前辈们数据处理完了吗,我也是最近在植物所做的实验,有一些问题询问?谢谢!
加油!
6楼2014-03-19 21:01:17
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crydevil

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

提供一下自己做法,供参考:
1.采用平均分子量;
2.在有些脂肪酸查不到文献时,建议采用通用分类方法,这个文献中有,我记得不清楚了。
3.结构式可以在质谱库中看到。只要知道化学式,不用结构式也可以计算分子量吧。。
7楼2014-03-20 14:28:36
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匿名

用户注销 (初入文坛)

本帖仅楼主可见
8楼2017-03-13 21:19:32
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872514103

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by crydevil at 2014-03-20 14:28:36
提供一下自己做法,供参考:
1.采用平均分子量;
2.在有些脂肪酸查不到文献时,建议采用通用分类方法,这个文献中有,我记得不清楚了。
3.结构式可以在质谱库中看到。只要知道化学式,不用结构式也可以计算分子量 ...

您好,请问您说的平均分子量是指目标PLFA与19:0的平均分子量吗?还有19:0的峰值在计算是是不是应该是统一的?如果是统一的是怎么得到的呢?十分感谢
9楼2018-06-21 15:53:21
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872514103

新虫 (初入文坛)

请问楼主确定计算方法了吗?您在计算过程中19:0的峰值是用的统一的吗?如果是那怎么得到呢?
10楼2018-06-21 15:55:05
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