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含羞草liu

新虫 (小有名气)

[求助] 求高手帮忙分析PCA图

大家好!我最近看到一篇文献,是用PCA技术(Principal Component Analysis)进行分析的,得到一个图。但我看不明白,求高手指教,感激不尽!!!
求高手帮忙分析PCA图
PCA分析图.jpg
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努力,奋斗,拼搏。。。
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你想要什么回答?
图里PC后面都有数字,就是这个component能代表多少原始数据。比如b图就比a图好,3个PC可以表达 61+28+8=97%的数据,换句话说,就算你原来的变量有二三十个,绝大部分的结果都可以用三个变量来预测。
2楼2013-09-22 08:06:05
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含羞草liu

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2013-09-22 08:06:05
你想要什么回答?
图里PC后面都有数字,就是这个component能代表多少原始数据。比如b图就比a图好,3个PC可以表达 61+28+8=97%的数据,换句话说,就算你原来的变量有二三十个,绝大部分的结果都可以用三个变量来预测 ...

我没有做过PCA,所以对这个了解太少,只知道是聚类分析得到的结果。我的问题还挺多的,有以下几个方面:
1、PC1、PC2、PC3 后面的百分比代表什么意思?这三个主要成分又是指什么?是图中所示的Sucrose、Inositol、Salicin、Caffeine这几个物质吗?
2、PC1、PC2、PC3在的三个轴,每个轴上的数值有负有正, 这些数值是什么意思呢?
3、这个图得到的是三个平面,每个平面代表一个主要成分,那么,a图中怎么会有四种物质呢?而且还是两个物质在一起的?
4、图中的灰色箭头是什么意思?它所指的方向,又是怎么得来的?是人为手动加上去的,还是软件分析自动生成的?
我对这个图疑问重重,文献也看不太懂,麻烦帮忙分析,非常感谢!
努力,奋斗,拼搏。。。
3楼2013-09-22 10:43:05
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