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jxmingcyl

铁虫 (初入文坛)

[求助] PCR总是出现上下拖尾,前后都花费快半个月了,求虫友帮忙

这是我扩增后验证结果,目的条带大小是对的,但是出现上下拖尾了,不知道怎么办,我用的是天根的MIX,引物0.5微升的,模板稀释50和100倍结果是一样的
PCR总是出现上下拖尾,前后都花费快半个月了,求虫友帮忙
AOA扩增出现拖尾
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phoenix211

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我觉得这样的结果不影响后续回收吧?
楼主为什么纠结这个呢?
4楼2013-09-16 14:45:13
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RUI1990

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你可以做一个纯阴性对照,即不加模板,看看是否还会出现拖尾现象,出现了说明除模板外有试剂污染,影响PCR。
做自己
2楼2013-09-16 11:08:48
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firewolfbing

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-09-16 12:24:25
第一,你的点样量有点大,看mark就知道。
第二,你的特异性还可以,条带还是很单一的。只要做些优化就可以了,不知道你有没有优化了退火温度,如果没有,找下最佳退火应该能解决问题。
第三,天根的mix没用过,不知道Mg加的是多少,你的片段的扩增效率很好,可以适当的降低Mg离子的浓度。
(你的6,7两个条带就很好看啊,很特异,很漂亮。其实你的拖带不明显的,切个胶就能做后续试验了。)
3楼2013-09-16 11:12:08
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jxmingcyl

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by phoenix211 at 2013-09-16 14:45:13
我觉得这样的结果不影响后续回收吧?
楼主为什么纠结这个呢?

我不回收直接去做DGGE,所以这种拖尾就很让人头疼了
5楼2013-09-16 19:16:34
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