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tangjia16888

银虫 (小有名气)

[求助] 高斯计算中固定部分角度作优化

高斯09计算,固定二面角作分子的优化,需要加什么关键字,需要固定原子还是什么,需要固定的原子后加数字1,不固定的原子后加数字0,但是计算显示出错,请问是不是在输入文件末尾还应加什么关键字吗?
请路过的高手能指点一二,非常感谢!!!
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-09-09 15:19:41
使用内坐标

Opt=ModRedun
2楼2013-09-09 10:30:50
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zjx187

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-09-09 15:19:51
tangjia16888: 金币+5, 引导思路 2013-09-09 16:40:30
我觉得最好用矩阵坐标来表示原子,这样直接就可以把你想固定的某个原子的二面角的数值放在分子说明部分就行了,这样不用加任何关键词,但是如果用xyz坐标表示每个原子就要加入关键词了
努力做健康智慧的自己
3楼2013-09-09 10:34:28
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t13340033021

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
tangjia16888: 金币+5, 有实质性的帮助 2013-09-09 16:41:31
gkf高: 金币+2 2013-09-10 11:14:39
尾部加上

D  * * * * F
就可以了
opt=ModRedun
甲烷无敌
6楼2013-09-09 16:00:52
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普通回帖

tangjia16888

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zjx187 at 2013-09-09 10:34:28
我觉得最好用矩阵坐标来表示原子,这样直接就可以把你想固定的某个原子的二面角的数值放在分子说明部分就行了,这样不用加任何关键词,但是如果用xyz坐标表示每个原子就要加入关键词了

我现在是用的XYZ坐标,请问加什么关键字呢?
4楼2013-09-09 15:02:52
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tangjia16888

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by tangjia16888 at 2013-09-09 15:02:52
我现在是用的XYZ坐标,请问加什么关键字呢?...

因定的原子后加数字-1还是1, 变化的原子后是加数字0吧?
5楼2013-09-09 15:04:37
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tangjia16888

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by t13340033021 at 2013-09-09 16:00:52
尾部加上

D  * * * * F
就可以了
opt=ModRedun

还有一个问题,在固定的原子后加数字0,其它原子后加数字-1,对吗?万分感谢指点啊?
7楼2013-09-09 16:24:49
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t13340033021

金虫 (正式写手)

这是单独的直角坐标固定
甲烷无敌
8楼2013-09-10 09:35:54
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tangjia16888

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by t13340033021 at 2013-09-09 16:00:52
尾部加上

D  * * * * F
就可以了
opt=ModRedun

我只是对一个分子中一部分原子构成的二面角固定,最后加上D  * * * * F,怎么体现就是我要固定的那几个二面角呢?
9楼2013-09-12 08:25:08
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t13340033021

金虫 (正式写手)

甲烷无敌
10楼2013-09-12 08:59:49
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