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锋线杀手

银虫 (小有名气)

[求助] 高斯优化求助

大家好，本人在做优化的时候有几个问题想确认一下，谢谢!
1.激发态的优化是必须在基态优化的基础上进行的吗？
2.一个约50原子的体系，没有重原子，做激发态优化一般要多久？
3.关于“进行能量计算可以得到一个激发态”这句话怎样理解？
4.固定键长时做势能面扫描怎样进行？求输出文件处理方法最好
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1楼 2011-06-30 20:19:37
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daiyulan85

木虫 (正式写手)
1.是的，并且最好统一方法和基组
2.这个没有定论，得看你用的方法和基组，结构，还有所选的态数。不过可以给个参考：我算过一个20个原子的体系，用MPW1PW91/6-311++g**  NStates=50  nproc=4,time:3 hours 44 minutes 44.3 seconds

3.不知道
4.不是很明了，
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计算化学光谱
2楼2011-06-30 21:18:52
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 2011-06-30 22:21:55
引用回帖:
Originally posted by 锋线杀手 at 2011-06-30 20:19:37:
大家好，本人在做优化的时候有几个问题想确认一下，谢谢!
1.激发态的优化是必须在基态优化的基础上进行的吗？
2.一个约50原子的体系，没有重原子，做激发态优化一般要多久？
3.关于“进行能量计算可以得到一个 ...

3. 因为不管是CIS还是EOM-CC还是TD-DFT，
求解激发态的能量都需要基态时计算得到的全部能量本征值。
这比较像是MP2，计算第i个激发态时有一项类似这样：

\sum_j/(w^2+(E-Ej)^2)

所以做激发态计算必须先做基态能量计算。
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3楼2011-06-30 21:39:44
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 2011-06-30 22:22:01
锋线杀手(金币+5): 我已经做了TS的优化，我是想固定一个官能团做整个分子的基态到激发态过程的势能面扫描 2011-07-01 20:04:06
引用回帖:
Originally posted by 锋线杀手 at 2011-06-30 20:19:37:
大家好，本人在做优化的时候有几个问题想确认一下，谢谢!
1.激发态的优化是必须在基态优化的基础上进行的吗？
2.一个约50原子的体系，没有重原子，做激发态优化一般要多久？
3.关于“进行能量计算可以得到一个 ...

4. 这是flexible scan的意思。固定某些化学键的键长，其它的自由度做优化。这是估计反应路径的第一步。接下来要做QST2或者QST3 refine这条路径，并寻找TS。
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4楼2011-06-30 21:41:34
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
Originally posted by yongleli at 2011-06-30 21:41:34:
4. 这是flexible scan的意思。固定某些化学键的键长，其它的自由度做优化。这是估计反应路径的第一步。接下来要做QST2或者QST3 refine这条路径，并寻找TS。

请楼主搞清楚概念。
“基态到激发态的过程”是一个很快的过程，
目前似乎没有直接模拟的文章，而且，
据我的认识，一般是从基态垂直激发到激发态，
然后再在振动激发的激发态上，经过振动能级的弛豫，
即分子内振动重分配过程，达到激发态的基态（如果有的话。
也有的情况下，激发态的能量最低点在无穷远，激发态的分子就会解离）。

我猜测，你要做的事情并非是垂直激发上去的过程而是弛豫的过程。
那么也就是跟基态的flexible scan原理是一样的。
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5楼2011-07-01 21:49:56
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锋线杀手

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yongleli at 2011-07-01 21:49:56:
请楼主搞清楚概念。
“基态到激发态的过程”是一个很快的过程，
目前似乎没有直接模拟的文章，而且，
据我的认识，一般是从基态垂直激发到激发态，
然后再在振动激发的激发态上，经过振动能级的弛豫，
即 ...

你好，我想做的是激发态的分子内质子转移，我想做的是随着O-H键的变化，基态分子内质子转移和激发态分子内质子转移的势能变化，而我不知道怎么去扫描这个势能面。谢谢。
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6楼2011-07-01 21:58:53
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
Originally posted by 锋线杀手 at 2011-07-01 21:58:53:
你好，我想做的是激发态的分子内质子转移，我想做的是随着O-H键的变化，基态分子内质子转移和激发态分子内质子转移的势能变化，而我不知道怎么去扫描这个势能面。谢谢。

那么你需要扫两个势能面。
基态一个，激发态一个，分别扫描。
细节请查相关文献。方维海组里和
德国的MCTDH组里的人做过很多光化学反应的工作。
你的体系如果有conical intersection，
在这地方需要你用多参考方法计算。
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7楼2011-07-02 10:15:22
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

锋线杀手(金币+2): 2011-07-06 10:35:43
引用回帖:
Originally posted by yongleli at 2011-07-02 10:15:22:
那么你需要扫两个势能面。
基态一个，激发态一个，分别扫描。
细节请查相关文献。方维海组里和
德国的MCTDH组里的人做过很多光化学反应的工作。
你的体系如果有conical intersection，
在这地方需要你用多 ...

另，虽然你要研究一个动力学过程，
但是必须用静态的手段先计算一遍才行。
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8楼2011-07-02 10:16:17
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