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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » gaussian不同半经验优化得到的能量相差较大
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29050801

新虫 (小有名气)

[求助] gaussian不同半经验优化得到的能量相差较大

对于环糊精
在gaussian03有半经验方法做的优化
分析优化前后能量变化的时候
发现不同反方法
比如indo和cndo能量和pm3、mndo、am1的方法
得到的能量存在较大的差别

这个是在么回事呢？

部分数据如下
method        start energy                     opt energy
indo                -959.66624094            -960.70352462
pm3                -2.0396243                    -2.32245827
pm3mm        -2.0396243                    -2.32245827
cndo                -1000.05267491            -1001.05621726
mndo        -1.82755337                     -2.32491222
am1                -2.3098766                     -2.63882358
mindo3        -1.86971559                     -2.45535268
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1楼 2013-09-06 21:20:58
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
引用回帖:
3楼: Originally posted by 29050801 at 2013-09-08 10:47:02
谢谢!
原来是这样啊
看到好多最近优化的文献
优化方法都是PM3的
课题组师兄的意思是让我自己构建一个适合环糊精衍生物的优化方法
就让尝试了不同的方法

那这样的话
是不是只在AM1和PM3当中就可以了阿？...

如果你只用G03的话，只能从AM1、PM3二者中选，基本上精度都是半斤八两。
如果你用G09，建议改用PM6。
最好的方法是PM7，但是MOPAC2012才支持，这是免费的。
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29050801
4楼2013-09-08 14:30:13
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gkf高: 金币+4 2013-09-08 00:55:15
29050801: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-09-08 10:44:32
比较绝对能量是没有意义的。只有比较不同方法计算出来的不同构型之间的能量差才有意义。不同半经验方法选取的能量零点也不同，绝大多数半经验方法，诸如PM3、AM1实际上最终直接给出的是分子的生成焓，和CNDO/INDO以及从头算的结果的绝对大小毫无可比性。
只要计算AM1、PM3就够了，其它的都是更早期的半经验方法，精度必然更差
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2楼2013-09-07 23:35:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

29050801

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2013-09-07 23:35:08
比较绝对能量是没有意义的。只有比较不同方法计算出来的不同构型之间的能量差才有意义。不同半经验方法选取的能量零点也不同，绝大多数半经验方法，诸如PM3、AM1实际上最终直接给出的是分子的生成焓，和CNDO/INDO以 ...

谢谢!
原来是这样啊
看到好多最近优化的文献
优化方法都是PM3的
课题组师兄的意思是让我自己构建一个适合环糊精衍生物的优化方法
就让尝试了不同的方法

那这样的话
是不是只在AM1和PM3当中就可以了阿？
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个人主页http://cnrdn.com/pXg5
3楼2013-09-08 10:47:02
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