2楼: Originally posted by longytu at 2013-08-15 11:59:24
我是这么处理的：
  画完结构后，打开3d模式，然后用minimum energy处理进行能量最小化，然后保存成mo2格式文件，最后在Mgtools里面处理mo2文件，加氢、计算电荷、合并非极性氢，然后保存成pdb文件

2楼: Originally posted by longytu at 2013-08-15 11:59:24
我是这么处理的：
  画完结构后，打开3d模式，然后用minimum energy处理进行能量最小化，然后保存成mo2格式文件，最后在Mgtools里面处理mo2文件，加氢、计算电荷、合并非极性氢，然后保存成pdb文件

6楼: Originally posted by stevenchem at 2013-08-16 12:41:08
我一般分两步优化：
1.先用分子力场MM2做简单优化（分子画好后，点击图标MM2,就是下面有黑色箭头的一个）
2.优化好后，再点calculations下面GAMESS interface下面Minimize，直接点Run即可。
3.查看电荷在calcula ...

6楼: Originally posted by stevenchem at 2013-08-16 12:41:08
我一般分两步优化：
1.先用分子力场MM2做简单优化（分子画好后，点击图标MM2,就是下面有黑色箭头的一个）
2.优化好后，再点calculations下面GAMESS interface下面Minimize，直接点Run即可。
3.查看电荷在calcula ...

6楼: Originally posted by stevenchem at 2013-08-16 12:41:08
我一般分两步优化：
1.先用分子力场MM2做简单优化（分子画好后，点击图标MM2,就是下面有黑色箭头的一个）
2.优化好后，再点calculations下面GAMESS interface下面Minimize，直接点Run即可。
3.查看电荷在calcula ...