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watyu123

铁虫 (小有名气)

[求助] 怎么利用chembio3D优化自己画的配体分子,求详细步骤

怎么利用chembio3D优化自己画的配体分子,得到pdb文件,求详细步骤,thank you!
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longytu

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【答案】应助回帖

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我是这么处理的:
  画完结构后,打开3d模式,然后用minimum energy处理进行能量最小化,然后保存成mo2格式文件,最后在Mgtools里面处理mo2文件,加氢、计算电荷、合并非极性氢,然后保存成pdb文件
2楼2013-08-15 11:59:24
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