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怎么利用chembio3D优化自己画的配体分子，求详细步骤
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stevenchem
金虫 (小有名气)
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
watyu123: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢啦 2013-08-16 15:33:00
感谢参与，应助指数 +1
watyu123: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢啦 2013-08-16 15:33:00
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我一般分两步优化： 1.先用分子力场MM2做简单优化（分子画好后，点击图标MM2,就是下面有黑色箭头的一个） 2.优化好后，再点calculations下面GAMESS interface下面Minimize，直接点Run即可。 3.查看电荷在calculations下面extended huckel下面calculate charges。 4.至于pdb文件，在保存时选择保存为pdb的格式就可以了。 |
6楼2013-08-16 12:41:08
2楼2013-08-15 11:59:24
3楼2013-08-15 12:06:28
5楼2013-08-15 12:14:58
