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58153365

铜虫 (小有名气)


[资源] cif文件自动转成POSCAR,并固定z轴指定原子脚本

最近在做表面计算,为实现固定z轴指定原子,修改了下之前的虫友hedaors写的cif2pos脚本。
具体使用方法:
1. 从MS中导出cif文件(记得先Make P1再导出)
2.在Linux系统下,输入cif4slab cif文件名称 (回车)
3.输入元素符号 (回车)(为便于计算后生成cif文件,POSCAR的第一行自动改为所输入的元素)
4. 输入要固定的原子的分数坐标,比如输入0.25,则z轴分数坐标小于0.25的所有原子均固定。
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  • 附件 1 : cif4pos-slab
  • 2013-08-12 09:58:18, 4.62 K

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三少爷的猫

金虫 (小有名气)


引用回帖:
16楼: Originally posted by 三少爷的猫 at 2014-12-02 10:07:09
你好,问一下,如果固定的是大于多少的改一下脚本可以不~~求解改哪里

也是醉了,我知道了,互换一下FFF和TTT的位置
17楼2014-12-02 10:10:39
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查看全部 36 个回答

★★★ 三星级,支持鼓励

没看懂,你想干什么。
2楼2013-08-12 11:58:00
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58153365

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by gavinliu7390 at 2013-08-12 11:58:00
没看懂,你想干什么。

做表面计算的时候,想固定某些层的原子,在每个原子坐标后面手动输入TTT或者FFF太麻烦了,就啥整了下脚本
4楼2013-08-12 19:19:13
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xianglannihao

铜虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

请教楼主,我在运行时出现如下问题:
$ cif4pos-slab 文件名.cif
提示: No such file or directory
但我已经将cif文件拷到linux系统下
6楼2013-09-18 11:21:20
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ifmc12343楼
2013-08-12 15:04   回复  
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wucx12345楼
2013-09-17 08:25   回复  
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wuli88楼
2013-09-29 09:34   回复  
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pmm129楼
2013-10-27 14:06   回复  
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2013-11-12 15:03   回复  
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liangpei12楼
2013-11-14 19:45   回复  
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maoshanjun13楼
2013-12-03 10:38   回复  
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