24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
查看: 2354  |  回复: 9

wzzwwt

铁虫 (初入文坛)

[求助] CO2的POSCAR要怎么设置呢?原子位置坐标怎么设定?已有3人参与

CO2的POSCAR要怎么设置呢?原子位置坐标怎么设定?如何知道原子位置坐标?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

甲斐之虎

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-02-22 09:36:19
你先用MS画一下,然后倒出来不就可以了
别人笑我太疯颠,我笑他人看不穿。不见五陵豪杰墓,无花无酒锄作田。
2楼2014-02-21 13:35:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事,踏实做人

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-02-22 09:39:38
同意楼上的,先画CO2,然后把分子放在正方形晶胞中,导出来转换成POSCAR就可以了
http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
3楼2014-02-21 14:48:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wzzwwt

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2014-02-21 14:48:02
同意楼上的,先画CO2,然后把分子放在正方形晶胞中,导出来转换成POSCAR就可以了

MS里没有CO2,import 结构里的哪项呢?谢谢指导啦!
4楼2014-02-22 10:46:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hakuna

木虫 (知名作家)

查一下C-O键长,直接手写就行了,这么简单的结构,没必要那么大动干戈的,用MS,牛刀了
5楼2014-02-22 17:34:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
identation: 金币+2, 谢谢交流 2014-02-22 18:04:56
随手给你写一个吧
system=CO2
1.000
10.00  0.00  0.00
0.00  11.00  0.00
0.00  0.00  11.60
1  2
Selective dynamics
Direct
0.50  0.50  0.50  F  F  F
0.50  0.50  0.60  T  T T
0.50  0.50  0.40  T  T  T

slab 三边不等长,消除对称性
CO2中C-O键长11.6pm,所以c的长度取成11.6主要是为方便,如果显小,可以取为23.2,然后两个O原子的z坐标各向中心靠近0.05就可以了,优化后可以得到更准确结构
6楼2014-02-22 17:47:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事,踏实做人

引用回帖:
4楼: Originally posted by wzzwwt at 2014-02-22 10:46:11
MS里没有CO2,import 结构里的哪项呢?谢谢指导啦!...

自己建啊!
http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
7楼2014-02-22 23:18:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wzzwwt

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by hakuna at 2014-02-22 17:47:56
随手给你写一个吧
system=CO2
1.000
10.00  0.00  0.00
0.00  11.00  0.00
0.00  0.00  11.60
1  2
Selective dynamics
Direct
0.50  0.50  0.50  F  F  F
0.50  0.50  0.60  T  T T
0.50  0.50  0.40   ...

谢谢您指导!
有个地方不明白
0.5 0.5 0.5
0.5 0.5 0.6
0.5 0.5 0.4
这3个原子的位置是怎么得出的呢?
如果用cart坐标
要怎么设置呢?
8楼2014-02-24 16:36:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hakuna

木虫 (知名作家)

引用回帖:
8楼: Originally posted by wzzwwt at 2014-02-24 16:36:53
谢谢您指导!
有个地方不明白
0.5 0.5 0.5
0.5 0.5 0.6
0.5 0.5 0.4
这3个原子的位置是怎么得出的呢?
如果用cart坐标
要怎么设置呢?...

将C原子放在盒子中心并固定,两个O原子一上一下,O与C相差0.1个分数坐标,0.1X11.6=1.16 即C-O键长
cart就是直角坐标了
9楼2014-02-24 22:52:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

方方方大侠

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by hakuna at 2014-02-22 17:47:56
随手给你写一个吧
system=CO2
1.000
10.00  0.00  0.00
0.00  11.00  0.00
0.00  0.00  11.60
1  2
Selective dynamics
Direct
0.50  0.50  0.50  F  F  F
0.50  0.50  0.60  T  T T
0.50  0.50  0.40   ...

您好,那个C的坐标0.5 0.5 0.5 后面不是T T T吗?为什么是F F F
10楼2018-07-16 22:33:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 学员BqhKvV 的主题更新
信息提示
请填处理意见