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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » CO2的POSCAR要怎么设置呢？原子位置坐标怎么设定？
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wzzwwt

铁虫 (初入文坛)

[求助] CO2的POSCAR要怎么设置呢？原子位置坐标怎么设定？ 已有3人参与

CO2的POSCAR要怎么设置呢？原子位置坐标怎么设定？如何知道原子位置坐标？
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1楼 2014-02-21 11:48:08
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甲斐之虎

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-02-22 09:36:19
你先用MS画一下，然后倒出来不就可以了
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别人笑我太疯颠，我笑他人看不穿。不见五陵豪杰墓，无花无酒锄作田。
2楼2014-02-21 13:35:42
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事，踏实做人

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-02-22 09:39:38
同意楼上的，先画CO2,然后把分子放在正方形晶胞中，导出来转换成POSCAR就可以了
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http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
3楼2014-02-21 14:48:02
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wzzwwt

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2014-02-21 14:48:02
同意楼上的，先画CO2,然后把分子放在正方形晶胞中，导出来转换成POSCAR就可以了

MS里没有CO2，import 结构里的哪项呢？谢谢指导啦！
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4楼2014-02-22 10:46:11
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hakuna

木虫 (知名作家)
查一下C-O键长，直接手写就行了，这么简单的结构，没必要那么大动干戈的，用MS，牛刀了
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5楼2014-02-22 17:34:33
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hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
identation: 金币+2, 谢谢交流 2014-02-22 18:04:56
随手给你写一个吧
system=CO2
1.000
10.00  0.00  0.00
0.00  11.00  0.00
0.00  0.00  11.60
1  2
Selective dynamics
Direct
0.50  0.50  0.50  F  F  F
0.50  0.50  0.60  T  T T
0.50  0.50  0.40  T  T  T

slab 三边不等长，消除对称性
CO2中C-O键长11.6pm，所以c的长度取成11.6主要是为方便，如果显小，可以取为23.2，然后两个O原子的z坐标各向中心靠近0.05就可以了，优化后可以得到更准确结构
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6楼2014-02-22 17:47:56
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事，踏实做人
引用回帖:
4楼: Originally posted by wzzwwt at 2014-02-22 10:46:11
MS里没有CO2，import 结构里的哪项呢？谢谢指导啦！...

自己建啊！
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http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
7楼2014-02-22 23:18:03
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wzzwwt

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hakuna at 2014-02-22 17:47:56
随手给你写一个吧
system=CO2
1.000
10.00  0.00  0.00
0.00  11.00  0.00
0.00  0.00  11.60
1  2
Selective dynamics
Direct
0.50  0.50  0.50  F  F  F
0.50  0.50  0.60  T  T T
0.50  0.50  0.40   ...

谢谢您指导！
有个地方不明白
0.5 0.5 0.5
0.5 0.5 0.6
0.5 0.5 0.4
这3个原子的位置是怎么得出的呢？
如果用cart坐标
要怎么设置呢？
赞一下 回复此楼
8楼2014-02-24 16:36:53
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hakuna

木虫 (知名作家)
引用回帖:
8楼: Originally posted by wzzwwt at 2014-02-24 16:36:53
谢谢您指导！
有个地方不明白
0.5 0.5 0.5
0.5 0.5 0.6
0.5 0.5 0.4
这3个原子的位置是怎么得出的呢？
如果用cart坐标
要怎么设置呢？...

将C原子放在盒子中心并固定，两个O原子一上一下，O与C相差0.1个分数坐标，0.1X11.6=1.16 即C-O键长
cart就是直角坐标了
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9楼2014-02-24 22:52:27
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方方方大侠

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hakuna at 2014-02-22 17:47:56
随手给你写一个吧
system=CO2
1.000
10.00  0.00  0.00
0.00  11.00  0.00
0.00  0.00  11.60
1  2
Selective dynamics
Direct
0.50  0.50  0.50  F  F  F
0.50  0.50  0.60  T  T T
0.50  0.50  0.40   ...

您好，那个C的坐标0.5 0.5 0.5 后面不是T T T吗？为什么是F F F
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10楼2018-07-16 22:33:34
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