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莓林塔

木虫 (小有名气)

[求助] 已知基因的氨基酸序列,怎么在NCBI上找到核苷酸序列啊~~

被折磨一上午了来小木虫求助~我要找编码E.coli ferritin(大肠杆菌铁蛋白,最好是JM109,其他的E.coli也行)的核苷酸序列,去NCBI上搜protein找到了氨基酸序列(约为165个aa),但是用nucleotide就搜不到对应的核苷酸序列啊,大肠杆菌不是啥基因都有么~~谁帮忙找一下顺便告诉我怎么搜啊~~郁闷死了~
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huanghznd

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-07-30 15:44:11
找到了氨基酸序列,相应的核苷酸序列就出来了嘛。你可以把氨基酶连接贴上来的。
2楼2013-07-30 13:27:43
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莓林塔

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by huanghznd at 2013-07-30 13:27:43
找到了氨基酸序列,相应的核苷酸序列就出来了嘛。你可以把氨基酶连接贴上来的。

能具体点不??
3楼2013-07-30 13:28:40
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huanghznd

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 莓林塔 at 2013-07-30 13:28:40
能具体点不??...

你把链接贴上来吧,我进去看看
4楼2013-07-30 13:29:29
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莓林塔

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by huanghznd at 2013-07-30 13:29:29
你把链接贴上来吧,我进去看看...

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/YP_006120261.1
这是氨基酸序列,我要直接找到核苷酸序列的方法,不要手动的笨办法
5楼2013-07-30 13:46:51
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huanghznd

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
莓林塔: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2013-07-30 15:28:51
gyesang: 金币+3, 鼓励应助! 2013-07-30 15:46:14
找到一个 有
CDS   1..165
的地方,点击CDS,有链接。接下来你懂的
附上链接给你吧http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... mp;amp;report=fasta
6楼2013-07-30 14:11:28
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莓林塔

木虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by huanghznd at 2013-07-30 14:11:28
找到一个 有
CDS   1..165
的地方,点击CDS,有链接。接下来你懂的
附上链接给你吧http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/387615344?from=1957438&to=1957935&sat=27&sat_key=277549384&report= ...

好吧~我是在NC里人工手动选择的核苷酸位置。。。我找到了。。。。
7楼2013-07-30 15:28:37
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wmm1209

新虫 (初入文坛)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-07-31 09:33:01
在你给的氨基酸序列链接的网页右下角有个Related Information, 选里面的“Gene”,出来的网页点击GenBank,核苷酸序列就出来了
8楼2013-07-31 09:27:19
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李艳君2011

金虫 (小有名气)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-07-31 09:35:59
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... ;report=gbwithparts
打开了你的有氨基酸序列的网址, 在右侧Analyze this sequence处选择Highlight Sequence Features
然后你就发现你的氨基酸序列都被选中了,页面的右下角选择genebank或者fasta等形式的就可以了
9楼2013-07-31 09:30:55
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piaofu

木虫 (正式写手)

通过基因号查找,很容易
10楼2013-08-01 11:00:04
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