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孙妙妙

金虫 (小有名气)

[求助] 关于基因表达

自己克隆了一个植物基因,现在想在大肠感觉中表达它。但是不知道要怎么设计表达时用的引物?酶切位点怎么加?怎么考虑移码问题?准备选用peT30b作为表达载体,BL21为宿主菌,同时分析我的序列和载体序列及实验室情况,准备选择BamHI和NotI做双酶切,现在不知道酶切位点要怎么加在引物上,请各位大侠帮忙,谢谢!
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好好做实验!
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回帖置顶 ( 共有1个 )

lmcyjxs

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
孙妙妙: 金币+2, 有帮助, 谢谢,最起码有一点明白了 2013-07-09 19:35:08
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-07-09 21:31:33
1949stone: 回帖置顶 2013-07-10 08:38:28
我前段时间也在研究这个问题,在此说一下我的经验,
   按2楼说的,可在上下游引物的5'端各加一个酶切位点,同时最好保护碱基,具体数目你可以下载相关资料来看,这样PRC后就可以在目的片段上加上酶切位点了。到时用这两个酶来分别对载体和目的片段双酶切,回收纯化,再连接,转化,测序判断是否连接正确,再进行表达。
    你可以先借助软件,如Vector NTI来分析一下是否移码的问题,你需研究下你的表达载体是从哪里开始翻译的,然后,插入你的目的片段后,从载体翻译的起始按三个碱基来分析一下你的CDS区有无移码,没有就好。
    有大牛觉得我的说法不对的,欢迎指出并一起交流。
思路决定出路。。。
3楼2013-07-09 18:43:18
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普通回帖

白色毛衣

银虫 (小有名气)


kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-07-09 21:31:51
做表达的话,引物比较好设计,因为基因序列已经确定了,你在PCR引物设计的时候直接加上去就行吧,上游下游各加一个酶切位点,一般来说在酶切位点的前面加上保护性碱基
资源共享
2楼2013-07-09 17:55:55
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孙妙妙

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 白色毛衣 at 2013-07-09 17:55:55
做表达的话,引物比较好设计,因为基因序列已经确定了,你在PCR引物设计的时候直接加上去就行吧,上游下游各加一个酶切位点,一般来说在酶切位点的前面加上保护性碱基

这个我知道,我就是不晓得是不是直接紧挨着起始密码加,还有就是怎么考虑移码不移码
好好做实验!
4楼2013-07-09 19:33:47
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charles08

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 孙妙妙 at 2013-07-09 19:33:47
这个我知道,我就是不晓得是不是直接紧挨着起始密码加,还有就是怎么考虑移码不移码...

我也觉得这个是关键,有高手可以指点一二
5楼2013-07-09 22:05:49
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
1949stone: 金币+1, 学习下 2013-07-10 08:38:53
孙妙妙: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢 2013-07-10 15:16:09
引用回帖:
4楼: Originally posted by 孙妙妙 at 2013-07-09 19:33:47
这个我知道,我就是不晓得是不是直接紧挨着起始密码加,还有就是怎么考虑移码不移码...

要看一下你插入表达载体的位置,这和你选的酶切位点有关。peT30b是带有his-tag和多个其它标签的。从你选的位点上看,你做的表达蛋白是在N端的his-tag和S tag的融合蛋白。你要考虑的是你的目的基因插入后是否和前面带的这些tag构成移码。这只需要用软件分析一下就行了。
6楼2013-07-10 01:51:37
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孙妙妙

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by charles08 at 2013-07-09 22:05:49
我也觉得这个是关键,有高手可以指点一二...

我现在又知道了,一点这个移不移码要看你用的载体,然后结合你选的酶切位点来看的,不知道我这样说你能不能理解
好好做实验!
7楼2013-07-10 15:15:34
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御风(远)

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-07-12 16:57:06
引用回帖:
7楼: Originally posted by 孙妙妙 at 2013-07-10 15:15:34
我现在又知道了,一点这个移不移码要看你用的载体,然后结合你选的酶切位点来看的,不知道我这样说你能不能理解...

记得要去掉目的片段上的终止子(目的片段和载体各一个终止子,也可以是设计引物时,使用目的片段的终止子,自己在引物上设计组氨酸标签),选择好酶,只要插入片段后能保证标签正常翻译出来就好了。
8楼2013-07-12 15:54:03
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