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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » NPT系综下判断是否平衡的标志
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lucaca

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] NPT系综下判断是否平衡的标志

跑了一段NPT，600K，现在温度变化大概是600±40K，这个浮动可以判断体系在这一系综下达到平衡了吗？
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1楼2013-07-05 22:59:42
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beeMD

新虫 (初入文坛)
★
lucaca(金币+1): 谢谢参与
如果是做常规MD，数据收集，跑得时间越长越好，ns级的MD基本上不能说是一定平衡了，扩散过程绝大多数不可能是ns级的，还要注意用对了控温控压的方法

BeeMD.org开发团队
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9楼2014-06-26 18:15:00
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shengxiang

木虫 (著名写手)
★
lucaca(金币+1): 谢谢参与
判断是否平衡的话可以用能量啊，RMSD之类的信息
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2楼2013-07-05 23:54:53
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wbn

银虫 (小有名气)
★
lucaca(金币+1): 谢谢参与
NPT判断是否平衡难道不是看密度的波动么？
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3楼2013-07-06 03:53:40
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lucaca

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by shengxiang at 2013-07-05 23:54:53
判断是否平衡的话可以用能量啊，RMSD之类的信息

那么比如说RMSD，算出来的数值为多少的时候就算是平衡了？
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4楼2013-07-06 05:09:15
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