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既然NAMD是模拟多肽的结构，为什么有需要一个pdb文件作为input呢？
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如题，我是今天才学namd的新手，想模拟一段10个氨基酸的序列的loop，但是在namd教程上看到namd第一步就是需要一个pdb文件，我既然不知道结构就当然不会有pdb文件了，那这是怎么回事呀，求高手解答 |
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fhh2626
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