24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1248  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

fengshuai_

木虫 (正式写手)

[求助] 求助有关细菌菌种鉴定的问题

请问公司给的16S rDNA测序结果的拼接序列是编码链还是模板链,谢谢赐教,定有重谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

努力加油
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

loop00

木虫 (小有名气)

阿凡达

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
fengshuai_: 金币+20, ★★★很有帮助 2013-06-22 11:17:55
引用回帖:
4楼: Originally posted by fengshuai_ at 2013-06-19 08:34:08
谢谢你啊,我按你说的比对了一下,结果是上下两条链的碱基序号都是从低到高,和该属内其他种也是如此,是不是就说明该测序结果应该是编码链啊?...

刚刚回想了一下,16rRNA是不是不编码蛋白呢?它好像就是和核糖体蛋白结合的结构RNA,起到支架的作用,我搜了几个序列,用软件分析都没有ORF,应该不存在正义反义的问题;
关于画进化树,是不存在正反问题的,软件会分析,把所有输入序列方向调成一样,所以没有问题,不知道我的回答你满不满意
坚强面对生活
7楼2013-06-21 13:17:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

loop00

木虫 (小有名气)

阿凡达

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-06-18 21:24:07
fengshuai_: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-06-19 08:29:42
你好,你可以把序列复制下来,与NCBI下载的某菌种16sRNA比对,观察它的正反
NCBI的序列一般是可以看出正反的
16sRNA构建树的时候是不需要区分正反的,软件(比如MEGA)构建树的第一步是Align,会自动掉接正反的

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

坚强面对生活
3楼2013-06-18 19:30:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fengshuai_

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by loop00 at 2013-06-18 19:30:17
你好,你可以把序列复制下来,与NCBI下载的某菌种16sRNA比对,观察它的正反
NCBI的序列一般是可以看出正反的
16sRNA构建树的时候是不需要区分正反的,软件(比如MEGA)构建树的第一步是Align,会自动掉接正反的

谢谢你啊,我按你说的比对了一下,结果是上下两条链的碱基序号都是从低到高,和该属内其他种也是如此,是不是就说明该测序结果应该是编码链啊?
努力加油
4楼2013-06-19 08:34:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

125927YAN

新虫 (初入文坛)

呵呵,应该是编码链吧
5楼2013-06-20 17:00:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 305求调剂 +7 RuiFairyrui 2026-03-28 7/350 2026-03-29 00:40 by 544594351
[考研] 一志愿中南大学化学0703总分337求调剂 +5 niko- 2026-03-27 5/250 2026-03-28 14:25 by 唐沐儿
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +7 hanamiko 2026-03-27 7/350 2026-03-28 09:56 by 李上岸0921
[考研] 材料求调剂 一志愿哈工大总分298分,前三科223分 +5 dongfang59 2026-03-27 5/250 2026-03-28 04:53 by wxiongid
[考研] 求调剂推荐 材料 304 +15 荷包蛋hyj 2026-03-26 15/750 2026-03-28 04:13 by fmesaito
[考研] 272求调剂 +7 脚滑的守法公民 2026-03-27 7/350 2026-03-27 17:23 by laoshidan
[考研] 一志愿南师大0703化学 275求调剂 +4 Ripcord上岸 2026-03-27 4/200 2026-03-27 17:00 by zhyzzh
[考研] 07化学280分求调剂 +10 722865 2026-03-23 10/500 2026-03-27 15:51 by Plutoqq
[考研] 考研化学308分求调剂 +10 你好明天你好 2026-03-23 12/600 2026-03-27 14:43 by shangxh
[考研] 348求调剂 +4 小懒虫不懒了 2026-03-27 5/250 2026-03-27 12:47 by 果果妈咪
[考研] 333求调剂 +3 question挽风 2026-03-23 3/150 2026-03-27 11:29 by 不吃魚的貓
[考研] 材料求调剂 +5 .m.. 2026-03-25 5/250 2026-03-27 11:08 by 不吃魚的貓
[论文投稿] Journal of Mechanical Science and Technology +3 Russ_ss 2026-03-25 5/250 2026-03-27 10:49 by 陆小果画大饼
[考研] 351求调剂 +4 麦克阿磊 2026-03-24 4/200 2026-03-27 00:32 by wxiongid
[考研] 总分322求生物学/生化与分子/生物信息学相关调剂 +5 星沉uu 2026-03-26 6/300 2026-03-26 19:02 by macy2011
[考研] 284求调剂 +15 Zhao anqi 2026-03-22 15/750 2026-03-25 12:51 by wht0531
[考研] 318求调剂 +3 plum李子 2026-03-23 3/150 2026-03-25 09:42 by 雾散后相遇lc
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境,总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-23 8/400 2026-03-23 20:36 by Creta
[论文投稿] 急发核心期刊论文 +3 贤达问津 2026-03-23 5/250 2026-03-23 17:13 by 妹子不好惹
[考研] 280分求调剂 一志愿085802 +4 PUMPT 2026-03-22 7/350 2026-03-22 22:13 by 星空星月
信息提示
请填处理意见