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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求助有关细菌菌种鉴定的问题
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fengshuai_

木虫 (正式写手)

[求助] 求助有关细菌菌种鉴定的问题

请问公司给的16S rDNA测序结果的拼接序列是编码链还是模板链，谢谢赐教，定有重谢！
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努力加油
1楼 2013-05-24 20:37:00
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fengshuai_

木虫 (正式写手)
每人点我啊
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努力加油
2楼2013-06-18 09:55:35
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fengshuai_

木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by loop00 at 2013-06-18 19:30:17
你好，你可以把序列复制下来，与NCBI下载的某菌种16sRNA比对，观察它的正反
NCBI的序列一般是可以看出正反的
16sRNA构建树的时候是不需要区分正反的，软件（比如MEGA）构建树的第一步是Align，会自动掉接正反的

谢谢你啊，我按你说的比对了一下，结果是上下两条链的碱基序号都是从低到高，和该属内其他种也是如此，是不是就说明该测序结果应该是编码链啊？
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努力加油
4楼2013-06-19 08:34:08
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