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genomelin

银虫 (小有名气)

[交流] finish一个细菌基因组要多少钱，已经用hiseq 测并且拼接完了contig 现在做finish

如题

[ Last edited by genomelin on 2013-5-10 at 17:42 ]
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1楼 2013-05-09 18:22:54
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stevenshi021

新虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
wizardfan: 金币+2, 谢谢参与 2013-05-11 06:37:28
我想现在找有那个ion 那个厉害的家用机我想就10000就足够了吧！而且一般对细菌的某个酶什么感兴趣没有必要做全基因组的，可以设计多条兼并引物试着将目的基因调取出来再做测序了。全长出来后你还需要分析，是一样的时间！希望对你有用。
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2楼2013-05-10 11:22:42
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genomelin

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stevenshi021 at 2013-05-10 06:22:42
我想现在找有那个ion 那个厉害的家用机我想就10000就足够了吧！而且一般对细菌的某个酶什么感兴趣没有必要做全基因组的，可以设计多条兼并引物试着将目的基因调取出来再做测序了。全长出来后你还需要分析，是一样的 ...

他应该是测全基因组，用ion torrent 也行用hiseq barcode 也行，都差不多，但是要确定下多少钱，试剂是固定的，但是主要是要包finishing ，流程都是一样的，就是看报价，如果能用pacbio+hiseq更好，eg最近的NatMethod，不过估计国内没有几家能这么做的
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3楼2013-05-10 21:55:55
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