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Hliotrope

木虫 (著名写手)

[交流] 有没有微生物降解烃方面的虫友 已有6人参与

小硕一枚,硕一,马上进实验室了,课题大方向是微生物降解石油,实验题要自己找,看了些文献,想到一个题,微生物降解高浓度的长链烷烃,可是都搜不到这方面的文献,就找到一篇高浓度原油的,是这个题目没意义吗,还没跟导师说这个想法,等过完五一去找导师,各位虫友,微生物降解石油这方面都研究到什么程度了,找题目鸭梨山大啊,找的不好,说不定导师一顿批,上次同组的汇报不好,那顿批啊,我看着胆战心惊。。。。
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Someone
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WSW_Alone

木虫 (著名写手)


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7楼: Originally posted by Hliotrope at 2013-05-03 16:54:19
单一菌,研究的是降解效率,重点就是高浓度,再找找看吧...

做原油的还是很多的,国内外都应该有很多文献,最近看了一篇文献是针对Dietzia一株新种进行降解特性(包括了降解范围,降解条件等 )研究的Degradation of petroleum hydrocarbons (C6–C40) and crude oil by a novel Dietzia strain, 2011. Xing-Biao Wang et al., 你可以参阅一下。然后请教你几个问题:
1. 长链烷烃多为固态,你的高浓度如何定义?
2. 做单一菌的话你是自己重新筛选降解效率高的还是购买已经研究的比较透彻的菌株?
3. 做降解效率的话,你是想针对选定的单一菌株进行条件优化吗?
處世樹為模,本固任從枝葉動;立身錢作樣,內方還要外邊圓。
8楼2013-05-03 19:38:49
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WSW_Alone

木虫 (著名写手)


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9楼: Originally posted by Hliotrope at 2013-05-03 20:08:35
那篇文献我看过了,长链烷烃16碳以上为固态,高浓度只是一个大概得概念,我的想法是增加加入量,比如一般加200mg/L,那我可以做300mg/L的,然后多做几种不同长度的烷烃对比一下;单一菌是已经筛选出来的菌,主要针 ...

已经筛的菌是你们团队之前筛选的还是购买的?
根据你说的后面做单一菌的内容,请问你提出“高浓度”这一概念的意义何在?
你的主要目的似乎是针对单一菌的降解范围和降解过程进行研究,那你有没有考虑做一做不同烷烃底物对该菌相关基因表达量的影响?
處世樹為模,本固任從枝葉動;立身錢作樣,內方還要外邊圓。
10楼2013-05-03 20:42:28
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WSW_Alone

木虫 (著名写手)


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11楼: Originally posted by Hliotrope at 2013-05-03 21:02:05
好像是之前筛的菌,高浓度是针对应用来讲的,烃降解菌肯定是用来修复环境污染或者提高采油率,那遇到污染严重,烃含量高的环境中,相对于含量低的环境中菌的降解特性会有所不同,那么我打算的就是研究这种菌在高浓 ...

1. 方便说一下你们团队筛的菌有没有什么特殊之处,比如降解效率很高?降解范围很广?以及有没有开展过前期研究,研究到什么程度?与该菌同属或者同种的菌株有无相关报道,研究到什么程度?
2. 你是否考虑的是菌株对于原油的耐受程度?为何不直接用原油去做而要选择几种不同链长的烷烃?是想确定降解范围呢还是考虑该菌对于不同烷烃的耐受能力?
3. 你提到的这个提高采油率蛮有意义的,主要应该是菌株分泌的表面活性剂在起作用,那你有没有考虑过通过代谢调控使得类似的功能物质产量提高?
處世樹為模,本固任從枝葉動;立身錢作樣,內方還要外邊圓。
12楼2013-05-03 21:31:02
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WSW_Alone

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
株菌信息还是要搞清楚。

抑制与否这个我认为不好说,“抑制”与“不能利用”应该是两个概念。比如有的菌他有alkB基因(中长链)但是没有almA基因(拥有这个基因的菌株通常能降解长链烷烃,比如不动杆菌属的菌),他可能降解的范围不超过C20,你能说他是被C20以上的烷烃“抑制”了吗?alkB基因编码的跨膜蛋白因为中间有个色氨酸残基使得菌株不能羟化太长链长的烷烃,所以他能在长链烷烃为唯一碳源的培养基生长,个人觉得不一定是被抑制了,通常是说一个降解范围的问题。如果你要做抑制的话是否应该补充其它实验加以核实,菌确实是被抑制了而不是其他原因?

微生物驱油当然是个大方向了 呵呵。

多多交流
處世樹為模,本固任從枝葉動;立身錢作樣,內方還要外邊圓。
14楼2013-05-03 22:19:08
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WSW_Alone

木虫 (著名写手)

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15楼: Originally posted by Hliotrope at 2013-05-03 22:29:24
嗯,你说的有道理,基因这块看过这方面的文献,但是不太了解,就知道alkB基因还有那个细胞色素P450的能利用C20以内的烷烃,almA基因没看到过,我还一直想利用20碳以上的编码基因是哪种基因呢,今天受教了,跟你聊天 ...

客气,多多交流。
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16楼2013-05-03 22:47:58
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