| 查看: 866 | 回复: 2 | |||
YILUK金虫 (小有名气)
|
[求助]
用AutoDock做对接，在分析氨基酸残基的时候出错，是神马意思？？
|
|
错误代码如下： Python 2.5.2 (r252:60911, Feb 21 2008, 13:11:45) [MSC v.1310 32 bit (Intel)] on win32 Type "copyright", "credits" or "license()" for more information. **************************************************************** Personal firewall software may warn about the connection IDLE makes to its subprocess using this computer's internal loopback interface. This connection is not visible on any external interface and no data is sent to or received from the Internet. **************************************************************** IDLE 1.2.2 ==== No Subprocess ==== >>> ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3087, in doit self.build() File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 2912, in build self.intDescr = InteractionDescriptor(lig, macro, percentCutoff) File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\MolKit\interactionDescriptor.py", line 49, in __init__ self.build(detect_pi=detect_pi) File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\MolKit\interactionDescriptor.py", line 60, in build self.buildCloseContactAtoms(percentCutoff) # File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\MolKit\interactionDescriptor.py", line 69, in buildCloseContactAtoms self.macro_atoms, percentCutoff=percentCutoff) File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\MolKit\distanceSelector.py", line 111, in select cutoff = self.setupCutoff(checkAts, keyAts, cutoff) File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\MolKit\distanceSelector.py", line 219, in setupCutoff bigRC = Numeric.resize(checkRadii, (lenC, lenC)) File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\numpy\core\fromnumeric.py", line 615, in resize a = concatenate( (a,)*n_copies) MemoryError 求高手解答，不胜感激 |
回复此楼» 猜你喜欢
复试调剂，一志愿南农083200食品科学与工程
已经有4人回复
-
一志愿太原理工安全工程300分，求调剂
已经有3人回复
-
284求调剂
已经有11人回复
-
食品工程专硕求调剂
已经有3人回复
-
324求调剂
已经有7人回复
-
一志愿武汉理工，总分321，英一数二，求老师收留。
已经有4人回复
-
287求调剂
已经有7人回复
-
325求调剂
已经有5人回复
-
343求调剂
已经有4人回复
-
求调剂推荐 材料 304
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- autodock什么时候存在pi-pi interations？
已经有9人回复
- 用autodock做对接，box设置无法包括受体活性区域和配体
已经有6人回复
- 使用autodock4.2处理分子对接问题，在run autogrid时总是出错，请各位高人指点啊？？
已经有10人回复
- AutoDock参数设置问题
已经有6人回复
- 用AutoDock对接的结合能较小，可能是什么原因？
已经有7人回复
- 用AutoDock作分子对接前的小分子能量最小化问题
已经有6人回复
- 怎样设置柔性残基？
已经有6人回复
- 【求助】Autodock分析请教
已经有17人回复
- 【其他】autodock 保存文件
已经有14人回复
- 【求助】用autodock做对接，请问里面格子大小及其中心的选择依据
已经有9人回复
- 【求助】关于Autodock中Grid中的问题
已经有9人回复
- 【原创】AutoDock使用笔记总结－原创始发
已经有32人回复
win下用mgtools就经常出现这种问题，重启软件就可以了
2楼2013-05-03 12:01:40
YILUK
金虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 1071.3
- 散金: 2
- 红花: 1
- 帖子: 139
- 在线: 249.7小时
- 虫号: 664530
- 注册: 2008-11-29
- 性别: GG
- 专业: 放射医学
3楼2013-05-03 17:36:18
