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shengxiang

木虫 (著名写手)

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[交流] 高斯计算酶催化反应的溶剂化模型问题

高斯计算酶催化反应的话就是用的cluster model了，没办法直接考虑周围蛋白环境的影响，文献中普遍采用的方法是使用溶剂化效应，例如PCM模型等，文献中一般会说静电常数选为4，但是在这些模型中不可能有现成的直接应用于蛋白质的溶剂，请问做过的前辈们，这个地方是不是溶剂选择的就是水，只是把水的PCM模型的静电常数改为了4？
命令如下：

。。。。。。。
scrf=(PCM,Read,Solvent=Water)
。。。。。。。
。。。。。。。
radii=uaks
EPS=10

如果能有对于溶剂的指定的文献，还望提供以下，谢谢

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1楼 2013-04-28 10:23:52

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gzl9901

铁杆木虫 (文坛精英)

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祝福，祝福祝福！努力，再努力！再创佳绩！

2楼2013-04-30 12:00:09

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