应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 高斯计算酶催化反应的溶剂化模型问题
21/1返回列表
查看: 909  |  回复: 1
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

shengxiang

木虫 (著名写手)

[交流] 高斯计算酶催化反应的溶剂化模型问题

高斯计算酶催化反应的话就是用的cluster model了，没办法直接考虑周围蛋白环境的影响，文献中普遍采用的方法是使用溶剂化效应，例如PCM模型等，文献中一般会说静电常数选为4，但是在这些模型中不可能有现成的直接应用于蛋白质的溶剂，请问做过的前辈们，这个地方是不是溶剂选择的就是水，只是把水的PCM模型的静电常数改为了4？
命令如下：

。。。。。。。
scrf=(PCM,Read,Solvent=Water)
。。。。。。。
。。。。。。。
radii=uaks
EPS=10

如果能有对于溶剂的指定的文献，还望提供以下，谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2013-04-28 10:23:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gzl9901

铁杆木虫 (文坛精英)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
祝福，祝福祝福！努力，再努力！再创佳绩！
赞一下 回复此楼
2楼2013-04-30 12:00:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shengxiang 的主题更新
21/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭