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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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shengxiang

木虫 (著名写手)


[交流] 高斯计算酶催化反应的溶剂化模型问题

高斯计算酶催化反应的话就是用的cluster model了,没办法直接考虑周围蛋白环境的影响,文献中普遍采用的方法是使用溶剂化效应,例如PCM模型等,文献中一般会说静电常数选为4,但是在这些模型中不可能有现成的直接应用于蛋白质的溶剂,请问做过的前辈们,这个地方是不是溶剂选择的就是水,只是把水的PCM模型的静电常数改为了4?
命令如下:

。。。。。。。
scrf=(PCM,Read,Solvent=Water)
。。。。。。。
。。。。。。。
radii=uaks
EPS=10

如果能有对于溶剂的指定的文献,还望提供以下,谢谢
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gzl9901

铁杆木虫 (文坛精英)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
祝福,祝福祝福!努力,再努力!再创佳绩!
2楼2013-04-30 12:00:09
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