24小时热门版块排行榜    

查看: 5103  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

asd724210

银虫 (初入文坛)

[求助] 分子动力学的时间

我想问问各位大神
你们跑分子动力学
一般运行时间是多长
我用DS做,已经跑了100多小时了
不知道是不是死循环了
最后production设置是800ps的
蛋白是90多个氨基酸
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

MD资料

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yezhongfei

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我用的是standard dynamics cascade
进度有变化
到最后一步了
可是这一步运行时间按比之前几步总和都要长
希望若不熄灭,便会亮成心中的星光
4楼2013-04-01 18:07:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

tylgd2011

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-04-02 08:24:38
你是用的哪个模块跑动力学的?我用的forcite模块1000ps也就八九个小时,不过我的体系比较小(一共600多个原子),那你跑动力学这么长时间进度有变化吗?我感觉用不了这么长时间吧!
2楼2013-04-01 11:38:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

asd724210

银虫 (初入文坛)

chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-04-02 08:25:12
chaizhm: 金币-1 2013-04-02 08:25:39
引用回帖:
2楼: Originally posted by tylgd2011 at 2013-04-01 11:38:11
你是用的哪个模块跑动力学的?我用的forcite模块1000ps也就八九个小时,不过我的体系比较小(一共600多个原子),那你跑动力学这么长时间进度有变化吗?我感觉用不了这么长时间吧!

我用的是standard dynamics cascade
进度有变化
到最后一步了
可是这一步运行时间按比之前几步总和都要长
3楼2013-04-01 14:43:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jewelseeker

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-04-02 08:25:56
查看一下CPU占用情况,再查看一下进程中有没有CHARMm或是CHARMm.MPI之类的,如果没有,则说明任务出问题了。
人生是一种修行!
5楼2013-04-01 20:53:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +9 基诺咪客 2026-08-17 12/600 2026-08-19 09:49 by niuniu-1234
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +5 Tide man 2026-08-14 6/300 2026-08-19 09:41 by zyqchem
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +8 启萌科技 2026-08-12 29/1450 2026-08-19 09:38 by huixian257
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +52 医学老男孩 2026-08-13 114/5700 2026-08-19 09:38 by 医学老男孩
[基金申请] 今天放榜吗? +9 布布和一二 2026-08-19 9/450 2026-08-19 09:33 by zqycae
[基金申请] 什么时候开奖? +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 不应该看fileCode +8 且听虎啸 2026-08-12 10/500 2026-08-19 08:03 by luw152
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +4 Tide man 2026-08-12 5/250 2026-08-19 07:41 by 201120518022
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +10 yuleib84 2026-08-18 11/550 2026-08-19 07:30 by 羽毛枫f
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +3 瞬息宇宙 2026-08-15 3/150 2026-08-18 21:40 by xiaohuixin
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 9/450 2026-08-18 20:09 by 奶牛小黑
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
信息提示
请填处理意见