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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 细菌亲缘关系疑问
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dayanxiang

木虫 (正式写手)

[求助] 细菌亲缘关系疑问

请问同一种不同菌株的16S rDNA 序列有没有可能相似性只有87%？通常情况下没有，有没有特例，比如某些功能类群，非常感谢！
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你的态度决定你的高度
1楼2013-03-19 14:38:36
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lmhzy1987

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
dayanxiang: 金币+5, ★有帮助, 谢谢！ 2013-03-20 22:56:16
取决于你对于微生物种的定义，如果以16S为准的话一般同种不同株差异是很小的，但是如果你以功能类群，假设都是降解A的菌株，那就可能16S相差很大，简单说16S和你的功能类群二者没有直接联系，16S涉及的是一个系统发育关系。
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头疼的文库
4楼2013-03-20 21:20:58
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lmhzy1987

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by dayanxiang at 2013-03-20 23:06:30
非常感谢您的回复，我所说的种是分类学上的，不同菌株比如Acetobacterium woodii ATCC 29683 和Acetobacterium woodii DSM 1030
我现在是从ATCC买回来一株纯菌，培养之后克隆测序NCBI比对，相似性不到90%，是什么 ...

我能告诉你的是，菌保中心出错也是见过的，相似性不到90%的话，你可以给他们写信反馈下。然后从第三家再要一株吧，这个事确实比较倒霉
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头疼的文库
8楼2013-03-21 11:01:37
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