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McTTony0712

新虫 (初入文坛)

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[求助] 对接前SYBYL-X 1.3 小分子如何优化？已有1人参与

最近在用SYBYL-X 1.3模拟小分子与大分子相互作用，做的过程中发现，画出的小分子优化（如设置虎克电荷）与不优化，最后得到的Total Score是不一样的，就连设置虎克电荷的次数不同，最后的打分值也不一样。在此请问各位大侠，小分子进行对接前是否需要优化，一般进行怎样的优化呢？谢谢

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在路上 /默默耕耘，等待破茧而出的一刻！/

1楼 2013-03-15 16:16:06

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yilanding

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【答案】应助回帖

不必优化电荷直接加氢，结构优化旧行

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