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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 求助~氨基酸序列拿到了~氨基酸功能结构域怎么找~
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小城大宝

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助~氨基酸序列拿到了~氨基酸功能结构域怎么找~

氨基酸序列拿到了，想分析结构，但是无从下手，请教各位如果想找功能结构域，该从拿下手找？是用软件，还是参考别人的文献来看？根据什么来找？折腾了几天没进展，苦闷。求指教。

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1楼 2013-03-10 16:41:41
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zhiwuyazhe

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
SMART 在google中输入 smart protein就可找到入口
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3楼2013-03-11 07:52:51
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
以下几个网站可以帮助你寻找蛋白序列上的结构域，希望对你有用！

1. NCBI Find conserved domains in your sequence (cds)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi

2. Expasy 的Prosite
http://prosite.expasy.org/

3. Pfam
http://pfam.janelia.org/

4. Interpro
http://www.ebi.ac.uk/interpro/
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2013-03-11 00:51:06
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d191675188

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
DNASTAR的protein可以分析
赞一下 回复此楼
12345677654322
4楼2013-03-11 09:07:18
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