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cuicchao

金虫 (正式写手)


[交流] 奇怪的连接反应

大家好!近来在做目的基因和质粒的连接,在转化时出现了一个奇怪的现象,请教大家分析下。我回收的目的基因和载体都还是比较纯的(用的是OMEGA试剂盒提取的)。我用TAKARA的solution1,16摄氏度,45min连接,之后直接转化DH5阿尔法,我做了全菌的PCR,再提取质粒PCR结果都有正确的结果,但是我跑质粒和双酶切的核算电泳胶都没有条带。这是问什么呢?!!!
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cuicchao

金虫 (正式写手)


引用回帖:
11楼: Originally posted by 554526385 at 2013-03-08 18:08:23
菌落PCR结果是不准确的,在你涂的平板上是有很多目的基因片段的,你挑菌之后PCR,即使是空载,也有未连接的目的基因片段做模版的。两个引物分别用载体上的和目的片段上的来做PCR,就会很准确。

“两个引物分别用载体上的和目的片段上的来做PCR。”——你是说将来PCR的结果片段是包含载体一部分碱基,目的基因的一部分碱基。对吗?
12楼2013-03-08 22:04:47
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无为书生

铁虫 (小有名气)



cuicchao(金币+2): 谢谢参与
全菌PCR和质粒PCR很可能是你的PCR体系污染了,建议做阴性对照,16度连45min是不是有点短,不要太相信连接酶的说明书了。
2楼2013-03-08 10:48:15
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cuicchao

金虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by 无为书生 at 2013-03-08 10:48:15
全菌PCR和质粒PCR很可能是你的PCR体系污染了,建议做阴性对照,16度连45min是不是有点短,不要太相信连接酶的说明书了。

不加目的基因和质粒做个阴性对照吗?
3楼2013-03-08 10:53:31
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无为书生

铁虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by cuicchao at 2013-03-08 10:53:31
不加目的基因和质粒做个阴性对照吗?...

不是,其实是每次做PCR时都应该做阴性对照的,就是PCR体系一样,但是模板用超纯水代替,PCR条件之类的也要完全一致。
4楼2013-03-08 10:58:53
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