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hraikeyan

金虫 (小有名气)

[求助] 从基因文库中筛选到目的基因后的分析

各位虫友:本人前段时间从构建好的基因文库中通过功能筛选,筛选到了一株阳性克隆。接着对 测序结果在NCBI中比对,没有能和测出的结果比对上的。因此不知道这段序列编码的是什么酶。
接着把测出的序列用Vector NTI进行ORF分析,如果 将正向测序结果输入(以M13+向开始)显示整个序列被分成很多个ORF,并且最大ORF也只不过500bp,我想这应该不足以编码我的目标蛋白(酰胺酶,实验室克隆出的相同功能的酰胺酶700多bp);如果将反向的测序结果输入(以M13-向开始)显示大致可以分俩个阅读框,一个1600bp左右,一个有700bp左右。
对于这样的结果我不知道该怎么分析,怎么设计引物克隆出目标编码基因?
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nothing isimpossible
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qqxs

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香。期待你的慷慨解囊。快乐每一天 2013-04-17 09:57:41
先把1600和700的两段分别在大肠杆菌里表达呗,有表型就行,不行的话在把正向的ORF分成两部分在大肠里表达,逐渐减小筛选范围。我想没有捷径。
4楼2013-03-04 17:47:24
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