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lyl0514

银虫 (小有名气)

[求助] vasp提交任务

请问各位:提交vasp任务后,出现任务序列号,当用qstat查任务时,任务消失,出现邮件提示,邮件内容如下,任务根本无法计算。请问这是什么问题呢?我要被逼疯了,请帮帮忙吧!!

Message 48:
From adm@cluster.hpc.org  Thu Feb 28 09:13:21 2013
X-Original-To: abc@cluster.hpc.org
Delivered-To: abc@cluster.hpc.org
To: abc@cluster.hpc.org
Subject: PBS JOB 5342.cluster.hpc.org
Precedence: bulk
Date: Thu, 28 Feb 2013 09:13:21 +0800 (CST)
From: adm@cluster.hpc.org (root)

PBS Job Id: 5342.cluster.hpc.org
Job Name:   2_6
Exec host:  compute-0-18/3+compute-0-18/2+compute-0-18/1+compute-0-18/0
Aborted by PBS Server
Job cannot be executed
See Administrator for help




Message 49:
From adm@cluster.hpc.org  Thu Feb 28 09:13:21 2013
X-Original-To: abc@cluster.hpc.org
Delivered-To: abc@cluster.hpc.org
To: abc@cluster.hpc.org
Subject: PBS JOB 5342.cluster.hpc.org
Precedence: bulk
Date: Thu, 28 Feb 2013 09:13:21 +0800 (CST)
From: adm@cluster.hpc.org (root)

PBS Job Id: 5342.cluster.hpc.org
Job Name:   2_6
Exec host:  compute-0-18/3+compute-0-18/2+compute-0-18/1+compute-0-18/0
An error has occurred processing your job, see below.
Post job file processing error; job 5342.cluster.hpc.org on host compute-0-18/3+compute-0-18/2+compute-0-18/1+compute-0-18/0Bad UID for job execution REJHOST=compute-0-18.local MSG=cannot find user 'abc' in password file
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llh2010

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★
fzx2008: 金币+3, 谢谢回帖! 2013-03-01 18:45:10
ssh -l abc  compute-0-18.local
中的 -l 就是一个减号和login的第一个字母l  ,意思是使用abc这个用户名登陆compute-0-18.local。
只要参与计算的各台服务器和主服务器之间可以进行无密码通讯便可。
看来你对linux不熟,估计这个问题你自己解决不了。你可以找机器的管理员或是给你安装vasp和PBS任务调度的人来看看。
知识引导人生,学习成就未来
8楼2013-03-01 11:05:39
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查看全部 9 个回答

llh2010

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+2, 谢谢指导 2013-03-01 18:44:04
从你给的错误提示的最后一句cannot find user 'abc' in password file来看,我觉得有可能是在compute-0-18.local 这台机器上没有建立无密码通讯。你试试用ssh以abc用户登录到这台机器上,看看需不需要输入密码。如果需要输入密码,应该就是这个原因。如果不需要输入密码,那就是其他原因。
知识引导人生,学习成就未来
2楼2013-02-28 16:56:26
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lyl0514

银虫 (小有名气)

谢谢帮助,我用getent passwd abc 看到库里有abc的用户。
我用您的方法试试,十分感谢!
3楼2013-02-28 18:01:09
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lyl0514

银虫 (小有名气)

还有个问题,我一次次尝试提交任务的时候,错误邮件提示有不同的机器,除了compute-0-18.local ,还有compute-0-0.local等等,用户abc怎样登陆呢?
4楼2013-02-28 18:06:04
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