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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp提交任务
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lyl0514

银虫 (小有名气)

[求助] vasp提交任务

请问各位：提交vasp任务后，出现任务序列号，当用qstat查任务时，任务消失，出现邮件提示，邮件内容如下，任务根本无法计算。请问这是什么问题呢？我要被逼疯了，请帮帮忙吧！！

Message 48:
From adm@cluster.hpc.org  Thu Feb 28 09:13:21 2013
X-Original-To: abc@cluster.hpc.org
Delivered-To: abc@cluster.hpc.org
To: abc@cluster.hpc.org
Subject: PBS JOB 5342.cluster.hpc.org
Precedence: bulk
Date: Thu, 28 Feb 2013 09:13:21 +0800 (CST)
From: adm@cluster.hpc.org (root)

PBS Job Id: 5342.cluster.hpc.org
Job Name:   2_6
Exec host:  compute-0-18/3+compute-0-18/2+compute-0-18/1+compute-0-18/0
Aborted by PBS Server
Job cannot be executed
See Administrator for help




Message 49:
From adm@cluster.hpc.org  Thu Feb 28 09:13:21 2013
X-Original-To: abc@cluster.hpc.org
Delivered-To: abc@cluster.hpc.org
To: abc@cluster.hpc.org
Subject: PBS JOB 5342.cluster.hpc.org
Precedence: bulk
Date: Thu, 28 Feb 2013 09:13:21 +0800 (CST)
From: adm@cluster.hpc.org (root)

PBS Job Id: 5342.cluster.hpc.org
Job Name:   2_6
Exec host:  compute-0-18/3+compute-0-18/2+compute-0-18/1+compute-0-18/0
An error has occurred processing your job, see below.
Post job file processing error; job 5342.cluster.hpc.org on host compute-0-18/3+compute-0-18/2+compute-0-18/1+compute-0-18/0Bad UID for job execution REJHOST=compute-0-18.local MSG=cannot find user 'abc' in password file
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1楼 2013-02-28 14:15:35
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llh2010

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 金币+2, 谢谢指导 2013-03-01 18:44:04
从你给的错误提示的最后一句cannot find user 'abc' in password file来看，我觉得有可能是在compute-0-18.local 这台机器上没有建立无密码通讯。你试试用ssh以abc用户登录到这台机器上，看看需不需要输入密码。如果需要输入密码，应该就是这个原因。如果不需要输入密码，那就是其他原因。
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知识引导人生，学习成就未来
2楼2013-02-28 16:56:26
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lyl0514

银虫 (小有名气)
谢谢帮助，我用getent passwd abc 看到库里有abc的用户。
我用您的方法试试，十分感谢！
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3楼2013-02-28 18:01:09
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lyl0514

银虫 (小有名气)
还有个问题，我一次次尝试提交任务的时候，错误邮件提示有不同的机器，除了compute-0-18.local ，还有compute-0-0.local等等，用户abc怎样登陆呢？
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4楼2013-02-28 18:06:04
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lyl0514

银虫 (小有名气)
我用ssh以abc用户登录到主服务器上，需要输入密码，请问该怎样解决“没有建立无密码通讯”的问题呢？
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5楼2013-02-28 18:10:53
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llh2010

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★
fzx2008: 金币+3, 谢谢回帖！ 2013-03-01 18:44:39
不知道你以前有没有提交任务成功过？
登录主服务器需要密码没关系，登录到主服务器后，使用命令
ssh -l abc  compute-0-18.local
从主服务器登录到compute-0-18.local 机器上，如果这时需要密码，则是没有建立无密码通讯。
如果你对linux很熟，那么到网上找找ssh怎么建立无密码通讯，直接设置一下就行。
如果不熟，那找管理员帮忙吧。
如果不是这个原因那我就不知道怎么解决了。
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知识引导人生，学习成就未来
6楼2013-02-28 18:59:56
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lyl0514

银虫 (小有名气)
谢谢！！
我提交任务，从来没成功提交过。
ssh -l abc  compute-0-18.local 中的-l  是什么符号呢？
如果是很多computer，比如compute-0-0.local 需要逐个登陆吗？
谢谢~~~
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7楼2013-03-01 09:19:16
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llh2010

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★
fzx2008: 金币+3, 谢谢回帖！ 2013-03-01 18:45:10
ssh -l abc  compute-0-18.local
中的 -l 就是一个减号和login的第一个字母l  ，意思是使用abc这个用户名登陆compute-0-18.local。
只要参与计算的各台服务器和主服务器之间可以进行无密码通讯便可。
看来你对linux不熟，估计这个问题你自己解决不了。你可以找机器的管理员或是给你安装vasp和PBS任务调度的人来看看。
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知识引导人生，学习成就未来
8楼2013-03-01 11:05:39
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xiaoboy185

金虫 (正式写手)
请问楼主这个问题是否已经解决了？
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9楼2014-11-18 16:05:53
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