应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » ENCUT测试脚本
181/2返回列表12下一页
查看: 3447  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

butterflyyh

木虫 (著名写手)

[求助] ENCUT测试脚本

使用VASP的ENCUT测试脚本optencut.sh：
rm WAVECAR
for i in 100 150 200 250 300 350 400 450 500 550 600
do
cat > INCAR < SYSTEM = bcc Fe
ENCUT = $i
ISTART = 0 ; ICHARG = 2
ISMEAR = -5
PREC = Accurate
!
echo "ENCUT = $i eV"; time vasp
E=$(grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1| awk '{printf "%12.6f \n", $5}')
echo $i $E >> comment
done
执行后出错：syntax error: unexpected end of file
optencut.sh脚本是我按照VASP计算前的验证写的，请问有没有人知道出错原因？多谢
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

VASP

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
nothingisimpossible
1楼 2011-08-13 22:05:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

youzhizhe

荣誉版主 (职业作家)

有志者

优秀版主优秀版主
引用回帖:
1楼: Originally posted by butterflyyh at 2011-08-13 22:05:50:
使用VASP的ENCUT测试脚本optencut.sh：
rm WAVECAR
for i in 100 150 200 250 300 350 400 450 500 550 600
do
cat > INCAR <<!
SYSTEM = bcc Fe
ENCUT = $i
...

问题出在最后两句上 修改结果如下
E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f\n",$5}'`
echo $i $E >> comment

应该就没有问题了。
赞一下(1人) 回复此楼
微博http://weibo.com/10986069
11楼2011-08-19 16:36:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

leehb870605

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
butterflyyh(金币+15): 2011-08-17 18:01:40
youzhizhe(金币+3): 谢谢交流。 2011-08-17 19:56:40
1，脚本第一行的
#!/bin/sh
这句话不知道你写了没有，

2，如果你是在WINDOWS环境下的写的脚本，然后再在LINUX环境下运行，可能就会出如下问题，下面是我转的

Shell 尴尬一: syntax error:unexpected end of file
2010-05-23 21:20
在windows下写好了Shell 但是在linux下用
>> sh -n [filesName]  检查语法总是出一个错误 syntax error:unexpected end of file
原因如下:
dos文件传输到unix系统时,会在每行的结尾多一个^M,在vi的时候,当你用如下命令：
>>vi dos.txt
>>:set fileformat=unix
>>:w
就会看到这些存在于每行结尾的^M符号，这个就是产生syntax error:unexpected end of file的原因
解决方案：
在vi下把这些^M都删除后, 搞定！

3，E=$(grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1| awk '{printf "%12.6f \n", $5}') 这一句在我那里曾经出过问题，我把它更改过，再每次循环时ECHO一个总能，只是没有这句话后面那些控制输出格式的东西罢了，也可以尝试把这句删掉再试试（个人意见）
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-08-16 14:57:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

butterflyyh

木虫 (著名写手)
★ ★
youzhizhe: 建议你采用“引用回复”。 2011-08-17 19:57:07
mazuju028(金币+2): 谢谢交流 2011-08-19 08:26:07
1. 第一行的#!/bin/sh加了；

2.是在LINUX下直接编写的，没有每行结尾的^M符号现象；

3.不知道你有没遇到VASP没运算完就读取i 循环的现象？
赞一下(3人) 回复此楼
nothingisimpossible
3楼2011-08-17 18:04:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w76990480

荣誉版主 (文坛精英)

super-emuch

优秀版主文献杰出贡献文献杰出贡献
★
youzhizhe(金币+1): 谢谢提示。 2011-08-18 18:00:46
引用回帖:
3楼: Originally posted by butterflyyh at 2011-08-17 18:04:49:
1. 第一行的#!/bin/sh加了；

2.是在LINUX下直接编写的，没有每行结尾的^M符号现象；

3.不知道你有没遇到VASP没运算完就读取i 循环的现象？

如果是运行这个脚本的话，应该没有出现3的现象，我是没有遇见过
赞一下(1人) 回复此楼
专业文献求助
4楼2011-08-17 22:39:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Tea_Candy

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by w76990480 at 2011-08-17 22:39:29:
如果是运行这个脚本的话，应该没有出现3的现象，我是没有遇见过

您好 请教一下 我在运行这个脚本的时候就出现了3中所述的情况
time vasp这句我觉得值得商榷 因为我是在超算上算的
我把time vasp 这句改成了超算上提交任务的命令
结果运行发现 执行上述命令后 任务进入了排队状态 但脚本还是继续执行 结果就出现了3的情况
不知道您有没有办法解决这个问题 谢谢
赞一下 回复此楼
Life is more than Chemistry.
5楼2011-08-18 20:31:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w76990480

荣誉版主 (文坛精英)

super-emuch

优秀版主文献杰出贡献文献杰出贡献
★
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-08-19 16:33:41
引用回帖:
5楼: Originally posted by Tea_Candy at 2011-08-18 20:31:21:
您好 请教一下 我在运行这个脚本的时候就出现了3中所述的情况
time vasp这句我觉得值得商榷 因为我是在超算上算的
我把time vasp 这句改成了超算上提交任务的命令
结果运行发现 执行上述命令后 任务进入了排 ...

我没有加time vasp这句
赞一下(1人) 回复此楼
专业文献求助
6楼2011-08-18 21:30:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Tea_Candy

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by w76990480 at 2011-08-18 21:30:07:
我没有加time vasp这句

不加这句？？那怎么执行计算的任务呢？
赞一下 回复此楼
Life is more than Chemistry.
7楼2011-08-18 23:00:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w76990480

荣誉版主 (文坛精英)

super-emuch

优秀版主文献杰出贡献文献杰出贡献
引用回帖:
7楼: Originally posted by Tea_Candy at 2011-08-18 23:00:42:
不加这句？？那怎么执行计算的任务呢？

你不加试一下，我也不知道这个time vasp是什么意思
赞一下 回复此楼
专业文献求助
8楼2011-08-18 23:04:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Tea_Candy

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by w76990480 at 2011-08-18 23:04:33:
你不加试一下，我也不知道这个time vasp是什么意思

我试过了 这样不能执行计算任务。。。
能把您的计算脚本贴出来看看吗
赞一下 回复此楼
Life is more than Chemistry.
9楼2011-08-18 23:14:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

butterflyyh

木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Tea_Candy at 2011-08-18 20:31:21:
您好 请教一下 我在运行这个脚本的时候就出现了3中所述的情况
time vasp这句我觉得值得商榷 因为我是在超算上算的
我把time vasp 这句改成了超算上提交任务的命令
结果运行发现 执行上述命令后 任务进入了排 ...

我也是吧time vasp换成提交任务的命令，出现3的情况。现在还没攻克问题。。。谢谢
赞一下 回复此楼
nothingisimpossible
10楼2011-08-19 09:30:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 butterflyyh 的主题更新
181/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 279分求调剂 一志愿211 +3 chaojifeixia 2026-03-19 3/150 2026-03-20 05:47 by laoshidan
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-19 5/250 2026-03-19 23:51 by 23Postgrad
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +18 rare12345 2026-03-18 18/900 2026-03-19 22:36 by 学员8dgXkO
[考研] 271材料工程求调剂 +6 .6lL 2026-03-18 6/300 2026-03-19 15:41 by haoshis
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 346求调剂[0856] +3 WayneLim327 2026-03-16 6/300 2026-03-19 11:21 by WayneLim327
[考研] 328求调剂，英语六级551，有科研经历 +4 生物工程调剂 2026-03-16 12/600 2026-03-19 11:10 by 生物工程调剂
[考研] 一志愿华中科技大学，080502，354分求调剂 +4 守候夕阳CF 2026-03-18 4/200 2026-03-18 22:16 by li123456789.
[考研] 0703化学336分求调剂 +6 zbzihdhd 2026-03-15 7/350 2026-03-18 09:53 by zhukairuo
[考研] 265求调剂 +3 梁梁校校 2026-03-17 3/150 2026-03-18 09:12 by zhukairuo
[硕博家园] 湖北工业大学 生命科学与健康学院-课题组招收2026级食品/生物方向硕士 +3 1喜春8 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:18 by ber川cool子
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[基金申请] 今年的国基金是打分制吗？ 50+3 zhanghaozhu 2026-03-14 3/150 2026-03-16 17:07 by 北京莱茵润色
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 复试调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭