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[交流]
【求助】单机上优化截断能，K点，sigma值出现错误
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我在单机上优化截断能，K点，sigma值时总是出现下面的错误，下面以一个优化sigma值为例子，请大家帮忙分析下 文件INCAR： SYATEM =Al-fcc ENCUT=250 ISTART=0;ICHARG=2 ISMEAR=0;SIGMA=0.30 PREC=Accurate KPOINTS： Automatic generation 0 Monkhorst-Pack 9 9 9 0.0 0.0 0.0 POSCAR： Al-fcc 5.430 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 2 Direct 0.0 0.0 0.0 0.25 0.25 0.25 runsm文件： #!/bin/sh rm WAVECAR for i in 0.10 0.12 0.14 0.16 0.18 0.20 0.22 0.24 0.26 0.28 0.30 do cat >INCAR< SYATEM =Al-fcc ENCUT=250 ISTART=0;ICHARG=2 ISMEAR=0;SIGMA=$i PREC=Accurate ! echo "SIGMA=$i eV"; time vasp TS=`grep "EENTRO" OUTCAR |tail-1| awk '{printf "%12.6f\n",$5}'` echo $i $TS >>comment_sigma done 用命令./runsm >& log命令运行后，在log文件出现： SIGMA=0.10 eV time: cannot run vasp: No such file or directory Command exited with non-zero status 127 0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k 0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps ./runsm: 15: tail-1: not found SIGMA=0.12 eV time: cannot run vasp: No such file or directory Command exited with non-zero status 127 0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k 0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps ./runsm: 15: tail-1: not found SIGMA=0.14 eV time: cannot run vasp: No such file or directory Command exited with non-zero status 127 0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k 0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps ./runsm: 15: tail-1: not found SIGMA=0.16 eV time: cannot run vasp: No such file or directory Command exited with non-zero status 127 0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k 0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps ./runsm: 15: tail-1: not found SIGMA=0.18 eV time: cannot run vasp: No such file or directory Command exited with non-zero status 127 0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k 0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps ./runsm: 15: tail-1: not found SIGMA=0.20 eV time: cannot run vasp: No such file or directory Command exited with non-zero status 127 0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k 0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps ./runsm: 15: tail-1: not found SIGMA=0.22 eV time: cannot run vasp: No such file or directory Command exited with non-zero status 127 0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k 0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps ./runsm: 15: tail-1: not found SIGMA=0.24 eV time: cannot run vasp: No such file or directory Command exited with non-zero status 127 0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k 0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps ./runsm: 15: tail-1: not found SIGMA=0.26 eV time: cannot run vasp: No such file or directory Command exited with non-zero status 127 0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k 0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps ./runsm: 15: tail-1: not found SIGMA=0.28 eV time: cannot run vasp: No such file or directory Command exited with non-zero status 127 0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k 0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps ./runsm: 15: tail-1: not found SIGMA=0.30 eV time: cannot run vasp: No such file or directory Command exited with non-zero status 127 0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k 0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps ./runsm: 15: tail-1: not fou 在comment_sigma文件里面出现 0.10 0.12 0.14 0.16 0.18 0.20 0.22 0.24 0.26 0.28 0.30 |
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3楼2011-04-15 08:48:24
4楼2011-04-15 09:19:23
5楼2011-04-15 09:34:54
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9楼2011-04-15 09:53:43
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zzy870720z(金币+2): 谢谢详细指点 2011-04-15 10:05:46
zzy870720z(金币+2): 谢谢详细指点 2011-04-15 10:05:46
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我发个安装过程给你吧，就是mpi的安装过程，你试试： MPI安装 1.解压。 2.进入安装包 3. ./configure --prefix=/opt/mpi2/ FC=ifort F90=ifort !安装目录可改，就设置环境变量时注意一致就行。 4. make 5.make install. 6。设置环境变量：在~/.bashrc后面加入 export PATH=/opt/mpi2/bin/:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/opt/mpi2/lib/:$LD_LIBRARY_PATH ulimit -s unlimited 7。source ~/.bashrc 8。敲mpd & 测试 9。可能会不行，要修改 /etc/mpd.conf, a.在中写入MPD_SECRETWORD=123456 b.touch /etc/mpd.conf c.chmod 600 /etc/mpd.conf 10.再试，mpd & ;一般都会OK了。 |
10楼2011-04-15 10:02:20
11楼2011-04-15 10:02:47
12楼2011-04-15 21:52:58
13楼2011-04-16 09:35:34
14楼2011-04-16 13:30:44
15楼2011-04-16 17:47:28
16楼2011-04-16 17:48:19
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-04-16 20:44:15
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-04-16 20:44:15
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以下是十楼的，不是我说的 export PATH=/opt/mpi2/bin/:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/opt/mpi2/lib/:$LD_LIBRARY_PATH ulimit -s unlimited 7。source ~/.bashrc 就是这么办，PATH改成自己的vasp路径 LIBARY_PATH改成MPI并行数据库的路径（这个你如果没有装mpi的话，我不知用不用，本人没有装过单机版)，最后source即可 |
17楼2011-04-16 19:19:27
简单回复
RuaLl2楼
2011-04-15 08:19
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youzhizhe: 以后不允许纯表情回复了。可查看置顶【特别通知】。 2011-04-15 22:08:48
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