24小时热门版块排行榜    

查看: 2001  |  回复: 16
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

kuangfg1987

至尊木虫 (职业作家)


[交流] 【求助】单机上优化截断能,K点,sigma值出现错误

我在单机上优化截断能,K点,sigma值时总是出现下面的错误,下面以一个优化sigma值为例子,请大家帮忙分析下
文件INCAR:
SYATEM =Al-fcc
ENCUT=250
ISTART=0;ICHARG=2
ISMEAR=0;SIGMA=0.30
PREC=Accurate
KPOINTS:
Automatic generation
0
Monkhorst-Pack
9 9 9
0.0 0.0 0.0
POSCAR:
Al-fcc                                   
5.430
    0.0    0.5    0.5
    0.5    0.0    0.5
    0.5    0.5    0.0
2   
Direct
    0.0    0.0    0.0
    0.25   0.25   0.25
runsm文件:
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in 0.10 0.12 0.14 0.16 0.18 0.20 0.22 0.24 0.26 0.28 0.30
do
cat >INCAR< SYATEM =Al-fcc
ENCUT=250
ISTART=0;ICHARG=2
ISMEAR=0;SIGMA=$i
PREC=Accurate
!
echo "SIGMA=$i eV"; time vasp
TS=`grep "EENTRO" OUTCAR |tail-1| awk '{printf "%12.6f\n",$5}'`
echo $i $TS >>comment_sigma
done
用命令./runsm >& log命令运行后,在log文件出现:
SIGMA=0.10 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.12 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.14 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.16 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.18 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.20 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.22 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.24 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.26 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.28 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.30 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not fou
在comment_sigma文件里面出现
0.10
0.12
0.14
0.16
0.18
0.20
0.22
0.24
0.26
0.28
0.30
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snail594

金虫 (小有名气)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-04-16 20:44:15
以下是十楼的,不是我说的
export PATH=/opt/mpi2/bin/:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/opt/mpi2/lib/:$LD_LIBRARY_PATH

ulimit -s unlimited
7。source ~/.bashrc

就是这么办,PATH改成自己的vasp路径
LIBARY_PATH改成MPI并行数据库的路径(这个你如果没有装mpi的话,我不知用不用,本人没有装过单机版),最后source即可
17楼2011-04-16 19:19:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

snail594

金虫 (小有名气)



zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-04-15 09:05:31
kuangfg1987(金币+2): 2011-04-15 21:32:07
vasp没有计算,把执行路径export
3楼2011-04-15 08:48:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)



youzhizhe(金币+1): 谢谢提示。 2011-04-15 22:09:12
引用回帖:
Originally posted by kuangfg1987 at 2011-04-15 08:16:51:
我在单机上优化截断能,K点,sigma值时总是出现下面的错误,下面以一个优化sigma值为例子,请大家帮忙分析下
文件INCAR:
SYATEM =Al-fcc
ENCUT=250
ISTART=0;ICHARG=2
ISMEAR=0;SIGMA=0.30
PREC=Accurate
...

你先输入一下 mpd &在运行你的脚本看看!
4楼2011-04-15 09:19:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kuangfg1987

至尊木虫 (职业作家)


引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-15 09:19:23:
你先输入一下 mpd &在运行你的脚本看看!

输入后显示  程序“mpd”尚未安装。  您可以使用以下命令安装:
sudo apt-get install mpd
bash: mpd:找不到命令
5楼2011-04-15 09:34:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
RuaLl2楼
2011-04-15 08:19   回复  
youzhizhe: 以后不允许纯表情回复了。可查看置顶【特别通知】。 2011-04-15 22:08:48
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 EZ67DG6CvcKL 2026-08-31 3/150 2026-08-31 22:23 by o3EMxHUAQDtS
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 EZ67DG6CvcKL 2026-08-31 3/150 2026-08-31 22:14 by o3EMxHUAQDtS
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 EZ67DG6CvcKL 2026-08-31 3/150 2026-08-31 22:12 by o3EMxHUAQDtS
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
信息提示
请填处理意见