应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】单机上优化截断能，K点，sigma值出现错误
51/1返回列表
查看: 1615  |  回复: 16
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

kuangfg1987

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】单机上优化截断能，K点，sigma值出现错误

我在单机上优化截断能，K点，sigma值时总是出现下面的错误，下面以一个优化sigma值为例子，请大家帮忙分析下
文件INCAR：
SYATEM =Al-fcc
ENCUT=250
ISTART=0;ICHARG=2
ISMEAR=0;SIGMA=0.30
PREC=Accurate
KPOINTS：
Automatic generation
0
Monkhorst-Pack
9 9 9
0.0 0.0 0.0
POSCAR：
Al-fcc                                   
5.430
    0.0    0.5    0.5
    0.5    0.0    0.5
    0.5    0.5    0.0
2   
Direct
    0.0    0.0    0.0
    0.25   0.25   0.25
runsm文件：
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in 0.10 0.12 0.14 0.16 0.18 0.20 0.22 0.24 0.26 0.28 0.30
do
cat >INCAR< SYATEM =Al-fcc
ENCUT=250
ISTART=0;ICHARG=2
ISMEAR=0;SIGMA=$i
PREC=Accurate
!
echo "SIGMA=$i eV"; time vasp
TS=`grep "EENTRO" OUTCAR |tail-1| awk '{printf "%12.6f\n",$5}'`
echo $i $TS >>comment_sigma
done
用命令./runsm >& log命令运行后，在log文件出现：
SIGMA=0.10 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.12 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.14 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.16 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.18 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.20 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.22 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.24 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.26 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.28 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not found
SIGMA=0.30 eV
time: cannot run vasp: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
0.00user 0.00system 0:00.00elapsed ?%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+70minor)pagefaults 0swaps
./runsm: 15: tail-1: not fou
在comment_sigma文件里面出现
0.10
0.12
0.14
0.16
0.18
0.20
0.22
0.24
0.26
0.28
0.30
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼2011-04-15 08:16:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snail594

金虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-04-16 20:44:15
以下是十楼的，不是我说的
export PATH=/opt/mpi2/bin/:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/opt/mpi2/lib/:$LD_LIBRARY_PATH

ulimit -s unlimited
7。source ~/.bashrc

就是这么办，PATH改成自己的vasp路径
LIBARY_PATH改成MPI并行数据库的路径（这个你如果没有装mpi的话，我不知用不用，本人没有装过单机版)，最后source即可
赞一下(2人) 回复此楼
17楼2011-04-16 19:19:27
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

snail594

金虫 (小有名气)
★
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-04-15 09:05:31
kuangfg1987(金币+2): 2011-04-15 21:32:07
vasp没有计算，把执行路径export
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-04-15 08:48:24
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
★
youzhizhe(金币+1): 谢谢提示。 2011-04-15 22:09:12
引用回帖:
Originally posted by kuangfg1987 at 2011-04-15 08:16:51:
我在单机上优化截断能，K点，sigma值时总是出现下面的错误，下面以一个优化sigma值为例子，请大家帮忙分析下
文件INCAR：
SYATEM =Al-fcc
ENCUT=250
ISTART=0;ICHARG=2
ISMEAR=0;SIGMA=0.30
PREC=Accurate
...

你先输入一下 mpd &在运行你的脚本看看！
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-04-15 09:19:23
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kuangfg1987

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-15 09:19:23:
你先输入一下 mpd &在运行你的脚本看看！

输入后显示  程序“mpd”尚未安装。  您可以使用以下命令安装：
sudo apt-get install mpd
bash: mpd：找不到命令
赞一下 回复此楼
5楼2011-04-15 09:34:54
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
RuaLl2楼
2011-04-15 08:19   回复  
youzhizhe: 以后不允许纯表情回复了。可查看置顶【特别通知】。 2011-04-15 22:08:48
查看全部 17 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭