24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3515  |  回复: 17
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

butterflyyh

木虫 (著名写手)

[求助] ENCUT测试脚本

使用VASP的ENCUT测试脚本optencut.sh
rm WAVECAR
for i in 100 150 200 250 300 350 400 450 500 550 600
do
cat > INCAR < SYSTEM = bcc Fe
ENCUT = $i
ISTART = 0 ; ICHARG = 2
ISMEAR = -5
PREC = Accurate
!
echo "ENCUT = $i eV"; time vasp
E=$(grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1| awk '{printf "%12.6f \n", $5}')
echo $i $E >> comment
done
执行后出错:syntax error: unexpected end of file
optencut.sh脚本是我按照VASP计算前的验证写的,请问有没有人知道出错原因?多谢
回复此楼
nothingisimpossible
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w76990480

荣誉版主 (文坛精英)

super-emuch

优秀版主文献杰出贡献文献杰出贡献

引用回帖:
7楼: Originally posted by Tea_Candy at 2011-08-18 23:00:42:
不加这句??那怎么执行计算的任务呢?

你不加试一下,我也不知道这个time vasp是什么意思
专业文献求助
8楼2011-08-18 23:04:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答

leehb870605

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
butterflyyh(金币+15): 2011-08-17 18:01:40
youzhizhe(金币+3): 谢谢交流。 2011-08-17 19:56:40
1,脚本第一行的
#!/bin/sh
这句话不知道你写了没有,

2,如果你是在WINDOWS环境下的写的脚本,然后再在LINUX环境下运行,可能就会出如下问题,下面是我转的

Shell 尴尬一: syntax error:unexpected end of file
2010-05-23 21:20
在windows下写好了Shell 但是在linux下用
>> sh -n [filesName]  检查语法总是出一个错误 syntax error:unexpected end of file
原因如下:
dos文件传输到unix系统时,会在每行的结尾多一个^M,在vi的时候,当你用如下命令:
>>vi dos.txt
>>:set fileformat=unix
>>:w
就会看到这些存在于每行结尾的^M符号,这个就是产生syntax error:unexpected end of file的原因
解决方案:
在vi下把这些^M都删除后, 搞定!

3,E=$(grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1| awk '{printf "%12.6f \n", $5}') 这一句在我那里曾经出过问题,我把它更改过,再每次循环时ECHO一个总能,只是没有这句话后面那些控制输出格式的东西罢了,也可以尝试把这句删掉再试试(个人意见)
2楼2011-08-16 14:57:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

butterflyyh

木虫 (著名写手)

★ ★
youzhizhe: 建议你采用“引用回复”。 2011-08-17 19:57:07
mazuju028(金币+2): 谢谢交流 2011-08-19 08:26:07
1. 第一行的#!/bin/sh加了;

2.是在LINUX下直接编写的,没有每行结尾的^M符号现象;

3.不知道你有没遇到VASP没运算完就读取i 循环的现象?
nothingisimpossible
3楼2011-08-17 18:04:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w76990480

荣誉版主 (文坛精英)

super-emuch

优秀版主文献杰出贡献文献杰出贡献


youzhizhe(金币+1): 谢谢提示。 2011-08-18 18:00:46
引用回帖:
3楼: Originally posted by butterflyyh at 2011-08-17 18:04:49:
1. 第一行的#!/bin/sh加了;

2.是在LINUX下直接编写的,没有每行结尾的^M符号现象;

3.不知道你有没遇到VASP没运算完就读取i 循环的现象?

如果是运行这个脚本的话,应该没有出现3的现象,我是没有遇见过
专业文献求助
4楼2011-08-17 22:39:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 320求调剂 +6 深郊akm 2026-04-17 6/300 2026-04-20 18:57 by fs26jie
[论文投稿] 期刊推荐 +3 材料研究生 2026-04-15 5/250 2026-04-20 16:02 by 豆豆7758
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[教师之家] 又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗 +4 yexuqing 2026-04-19 4/200 2026-04-20 14:47 by brantleo
[考研] 297,工科调剂?河南农业大学本科 +15 河南农业大学-能 2026-04-14 15/750 2026-04-20 12:39 by Equinoxhua
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 297,工科调剂? +11 河南农业大学-能 2026-04-14 11/550 2026-04-19 20:07 by Equinoxhua
[考研] 291求调剂 +11 关忆北. 2026-04-14 11/550 2026-04-19 17:16 by 中豫男
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂 +10 小聂爱学习 2026-04-16 12/600 2026-04-19 16:51 by 中豫男
[考研] 291求调剂 +12 关忆北. 2026-04-14 13/650 2026-04-19 16:50 by 中豫男
[考研] 307中医考研调剂 +9 于以采蘩 2026-04-14 9/450 2026-04-19 08:41 by 烟雨流涯
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[考研] 急需调剂 +9 绝不放弃22 2026-04-15 10/500 2026-04-18 08:09 by chixmc
[考研] 一志愿中科大材料与化工,353分还有调剂学校吗 +10 否极泰来2026 2026-04-15 12/600 2026-04-17 17:54 by mapenggao
[考研] 一志愿沪9,生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
[基金申请] RY:中国产出的科学垃圾论文,绝对数量和比例都世界第一 +7 zju2000 2026-04-14 18/900 2026-04-16 11:36 by 欢乐颂叶蓁
[考研] 药学求调剂 +14 喽哈加油 2026-04-14 16/800 2026-04-16 10:15 by beilsong20
[考研] 求调剂学校 +14 不会吃肉 2026-04-13 16/800 2026-04-15 21:59 by noqvsozv
信息提示
请填处理意见