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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 单链DNA和发卡DNA电泳哪个跑得快些
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jinggobia

铜虫 (正式写手)

[求助] 单链DNA和发卡DNA电泳哪个跑得快些

我的单链DNA是36个碱基，发卡茎环DNA一共是46个碱基，其中两边的20个碱基互相杂交形成了10个碱基对的茎，中间有26个碱基形成了环，请问下这两个碱基在跑PAGE时哪个快，为什么？
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1楼 2013-01-22 21:37:37
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
jinggobia: 金币+1 2013-01-28 22:56:33
假设你说的PAGE是SDS-PAGE，那这个就只取决于分子量，和电荷，结构无关。
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2楼2013-01-23 02:46:52
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更深的蓝

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
自己动手跑一下胶就知道了
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低调务实！
3楼2013-01-23 14:48:51
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更深的蓝

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

15%-20%的非变性PAGE
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低调务实！
4楼2013-01-23 14:49:50
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晋霸仙

新虫 (初入文坛)
不好判断的~分子量，电荷等电点什么的都会有影响~
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待我长发及腰，你估计已经不行了~--！！！
5楼2013-01-23 23:11:30
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jinggobia

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2013-01-23 02:46:52
假设你说的PAGE是SDS-PAGE，那这个就只取决于分子量，和电荷，结构无关。

额，我就是用SDS-PAGE跑的，我听学长说发夹DNA的碱基应该减半算，这样的话发卡DNA就会比单链跑的快了，就是不知道这样算对么~实际跑了下也没看见有区别
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6楼2013-01-24 00:32:51
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jinggobia

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 更深的蓝 at 2013-01-23 14:48:51
自己动手跑一下胶就知道了

今天跑了下也没看见有很大区别
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7楼2013-01-24 00:33:43
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武京帅

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
jinggobia: 金币+1, ★有帮助 2013-01-28 22:57:29
应该是发卡跑得慢吧  除去电荷的话 按照密度来说应该是发卡慢点
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To be all you what you can be!
8楼2013-01-24 14:46:06
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greeneese

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by jinggobia at 2013-01-24 00:32:51
额，我就是用SDS-PAGE跑的，我听学长说发夹DNA的碱基应该减半算，这样的话发卡DNA就会比单链跑的快了，就是不知道这样算对么~实际跑了下也没看见有区别...

SDS-PAGE中的SDS破坏DNA的双链氢键杂交啊。这样发卡结构就根本不存在了。
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9楼2013-01-26 12:53:44
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