24小时热门版块排行榜    

查看: 897  |  回复: 5

cz_rubygd

铁杆木虫 (正式写手)


[交流] 帮忙看看有关研究蛋白质相互作用的分析方法问题

首先声明,本人不懂生物学,所以文献中有关实验方法的起始句不太明白。
1To determine whether the compounds inhibited bromodomain-histone binding we utilized a peptide displacement assay based on AlphaScreen technology.
这句话中,主要是采用“什么方法?生物的不懂,请给与解释”测定化合物抑制溴域蛋白-组氨酸的结合作用。

2 to investigate the selectivity of these compounds against other bromodomain, we employed a binding assay based on protein stablity shift.
这句话,依旧是后半句,生物学的分析方法,不懂,需要各位帮我扫盲。

3 To order to confirm that the dimethylisoxazole moiety was acting as a KAc minic and to elucidate structure-activity profiles for these compounds , we obtained the cocrystal structures of -------.
这句话就是KAc是啥缩写啊。
另外,有关对蛋白抑制作用的坐标图中, Y-坐标(RLUs)和X-坐标(Dose)分别代表什么含义,图贴不上去啊。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子生化实验经验积累

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang881007

金虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
cz_rubygd: 金币+4, 谢谢,protein stablity shift是什么情况? 2013-01-06 22:54:33
小丹木木: 金币+3, 鼓励交流 2013-01-07 16:30:31
你这篇文章的实验性非常强,有点像小综述。涉及的技术较多,
1. alpha Screen:  http://www.proteomebinders.org/meetings/alpbach/talks/Chevet.pdf
2.A bromodomain is a protein domain that recognizes acetylated lysine residues such as those on the N-terminal tails of histones所以是测定化合物对Bromodomain活性的抑制作用
3.这是研究蛋白结构性质的方法,可以阅读本文http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21674662
4.第三点,爱莫能助,缩写太多,而且没图不能判断
2楼2013-01-06 14:15:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ccharlien

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
cz_rubygd: 金币+2, 谢谢 2013-01-06 22:54:27
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2013-01-07 16:30:47
3. 实验室里KAc 一般是醋酸钾的缩写(Potassium acetate),没有上下文,不确定
RLUs一般是Relative Luciferase Units的缩写 Dose就是试剂的剂量
看起来是用了一个报告基因试验证明剂量对活性改变的影响
3楼2013-01-06 20:57:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang881007

金虫 (小有名气)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
cz_rubygd: 金币+2, 谢谢!麻烦近两天关注我在生物板块的其他求助帖,关于分子对接的 2013-01-07 13:09:30
KAc, 你得看看文中是否相符。我给你的文献有一篇就是做stability shift。 例如,你用热变性来考察蛋白稳定性, 由于条件的改变,加底物, 得到的曲线与无底物的就不一致。这就是稳定性漂移!
4楼2013-01-07 09:03:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luck_cc

金虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
多看看分子生物学的书吧,这些分子的实验都还是挺有用的
5楼2013-01-07 12:48:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2013-04-20 15:05   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 cz_rubygd 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 澳大利亚 Murdoch University 全奖博士招生(3个名额)地质化工冶金领域 +11 AI8RaGaPaSCR 2026-08-07 11/550 2026-08-13 16:15 by UAjPKo3ZlAnV
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +3 majunge000 2026-08-11 5/250 2026-08-13 16:10 by majunge000
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 11/550 2026-08-13 10:40 by ZH远山
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] filecode +13 documentary 2026-08-10 15/750 2026-08-12 15:56 by 云上清扬
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +8 Tide man 2026-08-10 9/450 2026-08-11 20:39 by beefly
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
信息提示
请填处理意见